48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1927 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1927  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  306  8e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0136451 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  47.22 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  39.02 
 
 		 370 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0522  cupin 2 domain-containing protein  36.46 
 
 		 162 aa  73.2  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0568  cupin 2 domain-containing protein  36.46 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1734  cupin 2 domain-containing protein  35.42 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1750  cupin 2 domain-containing protein  35.42 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1684  cupin 2 domain-containing protein  35.42 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1706  cupin 2, barrel  35.42 
 
 		 148 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129353  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.66 
 
 		 374 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  29.35 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  31.25 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  27.96 
 
 		 376 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.21 
 
 		 364 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  31.94 
 
 		 379 aa  53.1  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  28.57 
 
 		 379 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  27.47 
 
 		 387 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 370 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  33.78 
 
 		 342 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  28.38 
 
 		 370 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  33.78 
 
 		 342 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.37 
 
 		 377 aa  48.1  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  26.6 
 
 		 373 aa  47.8  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  26.37 
 
 		 353 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  32.43 
 
 		 345 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  32.43 
 
 		 345 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  32.43 
 
 		 345 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  32.43 
 
 		 345 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  32.43 
 
 		 345 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  27.5 
 
 		 181 aa  44.7  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.85 
 
 		 127 aa  44.3  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  32.04 
 
 		 347 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  27.08 
 
 		 344 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  30.49 
 
 		 361 aa  41.6  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1915  cupin 2 domain-containing protein  26.97 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  30.49 
 
 		 356 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  27.16 
 
 		 255 aa  41.2  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  27.16 
 
 		 361 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  27.16 
 
 		 361 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  27.16 
 
 		 361 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4894  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.52 
 
 		 177 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3018  cupin 2 domain-containing protein  27.83 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.609339  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  29.27 
 
 		 357 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 167 aa  40.8  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3461  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 		 130 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430569 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.85 
 
 		 350 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  30.39 
 
 		 129 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>