76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0677 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 361 aa  527  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 361 aa  528  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  99.61 
 
 		 361 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 255 aa  525  1e-148  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  98.43 
 
 		 361 aa  519  1e-146  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  98 
 
 		 356 aa  508  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  50.99 
 
 		 370 aa  268  5e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.79 
 
 		 350 aa  204  8e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 364 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.61 
 
 		 374 aa  171  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  39.08 
 
 		 368 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  41.04 
 
 		 379 aa  163  2.0000000000000002e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.87 
 
 		 370 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  41.63 
 
 		 373 aa  162  4.0000000000000004e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.53 
 
 		 377 aa  157  2e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  39.26 
 
 		 387 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  41.6 
 
 		 376 aa  157  2e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  40.42 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  40.42 
 
 		 348 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  41.46 
 
 		 379 aa  156  4e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  37.34 
 
 		 370 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  40.76 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  40.76 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  40.76 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  40.76 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  40.76 
 
 		 345 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  38.14 
 
 		 342 aa  149  3e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  38.49 
 
 		 370 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  38.14 
 
 		 342 aa  147  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  39 
 
 		 347 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  38.43 
 
 		 353 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  39.26 
 
 		 348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  39.42 
 
 		 348 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  39.67 
 
 		 364 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  39 
 
 		 347 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  39.83 
 
 		 348 aa  145  5e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  37.5 
 
 		 345 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  38.17 
 
 		 347 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  38.17 
 
 		 347 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  38.82 
 
 		 349 aa  140  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  37.66 
 
 		 353 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  36.17 
 
 		 348 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  37.55 
 
 		 348 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  34.69 
 
 		 364 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  36.51 
 
 		 362 aa  128  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  34.18 
 
 		 283 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  34.87 
 
 		 353 aa  125  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  34.32 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  34.6 
 
 		 372 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  31.8 
 
 		 357 aa  110  2.0000000000000002e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  33.73 
 
 		 367 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  33.75 
 
 		 365 aa  109  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.29 
 
 		 363 aa  107  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  32.64 
 
 		 377 aa  107  2e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  33.05 
 
 		 351 aa  106  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  31.15 
 
 		 344 aa  105  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  28.33 
 
 		 343 aa  104  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  31.06 
 
 		 334 aa  101  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  28.26 
 
 		 324 aa  99  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  29.74 
 
 		 351 aa  97.8  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  30.49 
 
 		 331 aa  94  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  29.31 
 
 		 351 aa  91.3  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  30.96 
 
 		 330 aa  88.2  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  28.03 
 
 		 349 aa  85.1  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  31.39 
 
 		 178 aa  67.8  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 181 aa  64.3  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  29.67 
 
 		 159 aa  52  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4258  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  29.33 
 
 		 368 aa  50.4  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1608  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.88 
 
 		 104 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00104789  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1662  cupin 2 domain-containing protein  32.88 
 
 		 108 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000140317  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  29.47 
 
 		 151 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  22.22 
 
 		 366 aa  45.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2750  hypothetical protein  28.21 
 
 		 130 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226239  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 		 153 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.21 
 
 		 121 aa  42.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.38 
 
 		 111 aa  42  0.01  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>