80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_2433 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  98.54 
 
 
342 aa  703    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  89.28 
 
 
345 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  89.57 
 
 
345 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  89.57 
 
 
345 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  89.57 
 
 
345 aa  655    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  89.28 
 
 
345 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  100 
 
 
342 aa  712    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  60.64 
 
 
348 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  60.64 
 
 
348 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  61.54 
 
 
370 aa  440  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  60.36 
 
 
348 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  60.87 
 
 
348 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  60.95 
 
 
364 aa  433  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  58.67 
 
 
347 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  59.54 
 
 
347 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  58.09 
 
 
347 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  60.29 
 
 
353 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  58.67 
 
 
347 aa  431  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  60.47 
 
 
348 aa  425  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  57.97 
 
 
353 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  56.77 
 
 
364 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  59.17 
 
 
362 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  54.52 
 
 
348 aa  398  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  56.63 
 
 
349 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  52.4 
 
 
345 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  52.35 
 
 
348 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  48.25 
 
 
353 aa  362  6e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  48.2 
 
 
344 aa  306  3e-82  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.48 
 
 
350 aa  271  8.000000000000001e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.2 
 
 
364 aa  270  4e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.1 
 
 
370 aa  249  5e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  39.7 
 
 
387 aa  245  8e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  39.22 
 
 
379 aa  243  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.01 
 
 
374 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  39.04 
 
 
376 aa  238  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  37.87 
 
 
370 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  36.9 
 
 
379 aa  233  3e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3145  cupin 2 domain-containing protein  37.68 
 
 
351 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.316651  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5250  cupin 2 domain-containing protein  37.8 
 
 
373 aa  222  6e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.665578 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0655  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.39 
 
 
377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  37.54 
 
 
368 aa  219  6e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  35.16 
 
 
357 aa  209  4e-53  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3670  cupin 2 domain-containing protein  37.24 
 
 
351 aa  209  6e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  36.18 
 
 
377 aa  206  3e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  35.31 
 
 
372 aa  205  8e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  37.84 
 
 
370 aa  203  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2675  cupin 2 domain-containing protein  35.4 
 
 
343 aa  202  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0738  cupin 2 domain-containing protein  34.81 
 
 
349 aa  202  9e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00190915 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  36.42 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  35.49 
 
 
367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2476  cupin 2 domain-containing protein  35.47 
 
 
334 aa  197  3e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1654  cupin 2 domain-containing protein  34.97 
 
 
361 aa  194  1e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1628  cupin 2, barrel  34.97 
 
 
356 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1601  cupin 2 domain-containing protein  34.97 
 
 
361 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0589  cupin 2 domain-containing protein  34.97 
 
 
361 aa  192  6e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  35.47 
 
 
365 aa  191  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0468  cupin 2 domain-containing protein  34.68 
 
 
361 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  34.01 
 
 
351 aa  191  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0280  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.74 
 
 
363 aa  186  5e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844091 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  34.52 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  33.43 
 
 
331 aa  182  7e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.110005 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  40.49 
 
 
283 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3276  cupin 2, barrel  30.33 
 
 
324 aa  149  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.525696  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0677  cupin 2 domain-containing protein  38.14 
 
 
255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  28.26 
 
 
178 aa  65.5  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1994  cupin 2 domain-containing protein  31.96 
 
 
181 aa  59.7  0.00000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.663759  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  34.41 
 
 
123 aa  54.7  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0334  hypothetical protein  30.83 
 
 
318 aa  53.1  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.66391  normal  0.0124994 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0679  cupin 2 domain-containing protein  28.68 
 
 
134 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1927  hypothetical protein  33.78 
 
 
148 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0136451 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4263  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  27.46 
 
 
366 aa  47.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3086  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  22.15 
 
 
366 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.407832  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  31.88 
 
 
159 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1684  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 
162 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1750  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 
162 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664618  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1734  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 
162 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1706  cupin 2, barrel  32 
 
 
148 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129353  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0522  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 
162 aa  43.5  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0568  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 
148 aa  43.5  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4258  gentisate 1 2-dioxygenase-like protein  30.53 
 
 
368 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>