59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1734 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_1734  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  330  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1750  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  330  4e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0664618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1684  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 162 aa  330  4e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0522  cupin 2 domain-containing protein  96.3 
 
 		 162 aa  319  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1706  cupin 2, barrel  100 
 
 		 148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.129353  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0568  cupin 2 domain-containing protein  95.27 
 
 		 148 aa  289  1e-77  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1927  hypothetical protein  35.42 
 
 		 148 aa  70.9  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0136451 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3034  gentisate 1,2-dioxygenase  34.41 
 
 		 370 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2861  hypothetical protein  34.48 
 
 		 159 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 370 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.45 
 
 		 364 aa  57.8  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0053  gentisate 1,2-dioxygenase  35.63 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2315  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.26 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4204  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 370 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0353  gentisate 1,2-dioxygenase  34.52 
 
 		 362 aa  53.9  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32690  gentisate 1,2-dioxygenase  35.44 
 
 		 353 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000796263  hitchhiker  0.0000100367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1087  gentisate 1,2-dioxygenase oxidoreductase protein  30.59 
 
 		 348 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.163907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5802  gentisate 1,2-dioxygenase  31.65 
 
 		 364 aa  50.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  30.23 
 
 		 348 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  31.65 
 
 		 348 aa  49.3  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4221  gentisate 1,2-dioxygenase  33.71 
 
 		 347 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3374  gentisate 1,2-dioxygenase  31.65 
 
 		 347 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203414  normal  0.250455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4145  gentisate 1,2-dioxygenase  33.71 
 
 		 347 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.121974  normal  0.0473391 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1889  gentisate 1,2-dioxygenase  31.65 
 
 		 347 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.319264 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  31.25 
 
 		 348 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  31.25 
 
 		 348 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2125  gentisate 1,2-dioxygenase  32.91 
 
 		 364 aa  48.9  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3059  gentisate 1,2-dioxygenase  26.21 
 
 		 349 aa  48.9  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0227445 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0146  gentisate 1,2-dioxygenase  30.59 
 
 		 370 aa  48.1  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00765211 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1387  cupin 2, barrel  28.32 
 
 		 379 aa  48.1  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.125216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2768  gentisate 1,2-dioxygenase  32.91 
 
 		 353 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.262603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3270  gentisate 1,2-dioxygenase  32.47 
 
 		 342 aa  47  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395363 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5102  gentisate 1,2-dioxygenase  27.78 
 
 		 283 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.562854 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4624  cupin 2 domain-containing protein  30.67 
 
 		 344 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2433  gentisate 1,2-dioxygenase  32 
 
 		 342 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3243  gentisate 1,2-dioxygenase  26.32 
 
 		 368 aa  46.2  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.39318 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0981  gentisate 1,2-dioxygenase  33.33 
 
 		 348 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.352055  hitchhiker  0.000255596 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0799  gentisate 1,2-dioxygenase  27.68 
 
 		 348 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2368  gentisate 1,2-dioxygenase  32 
 
 		 345 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0793193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2413  gentisate 1,2-dioxygenase  32 
 
 		 345 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2417  gentisate 1,2-dioxygenase  32 
 
 		 345 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2324  gentisate 1,2-dioxygenase  32 
 
 		 345 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2525  gentisate 1,2-dioxygenase  32 
 
 		 345 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2052  cupin 2 domain-containing protein  30.61 
 
 		 377 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.748893  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2454  cupin 2 domain-containing protein  25 
 
 		 351 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1707  Cupin domain protein  31.17 
 
 		 178 aa  44.3  0.0007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0167  cupin 2 domain-containing protein  29.57 
 
 		 365 aa  44.3  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.354659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2234  cupin 2, barrel  29.76 
 
 		 159 aa  44.3  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.328045 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2813  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 		 350 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.126651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20700  gentisate 1,2-dioxygenase  28.7 
 
 		 372 aa  43.5  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.280371  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0819  gentisate 1,2-dioxygenase  24.47 
 
 		 376 aa  43.9  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7501  gentisate 1,2-dioxygenase  28.4 
 
 		 345 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.398812 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1825  putative dioxygenase oxidoreductase protein  34.43 
 
 		 379 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.113884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3702  cupin 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 345 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.105919  normal  0.217217 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3565  cupin 2, barrel  32.43 
 
 		 367 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57210  hypothetical protein  33.78 
 
 		 330 aa  41.6  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4214  cupin 2 domain-containing protein  24.21 
 
 		 387 aa  41.2  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.358042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2910  cupin 2 protein  32.43 
 
 		 357 aa  41.6  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.305706  normal  0.232695 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55211  predicted protein  32 
 
 		 331 aa  41.2  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.110005 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>