62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4136 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 127 aa  256  9e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.46 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  33.06 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  36.73 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  38.04 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.45 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1816  cupin 2 domain-containing protein  29.57 
 
 		 123 aa  53.1  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.337557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.04 
 
 		 113 aa  52  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.82 
 
 		 128 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1466  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 206 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.609185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  54.55 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  41.38 
 
 		 137 aa  47.8  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2392  cupin 2 domain-containing protein  36.78 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.232938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  35.63 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  42.03 
 
 		 148 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2314  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 208 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.059917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  45.45 
 
 		 129 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1459  hypothetical protein  40.26 
 
 		 332 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0434689  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.63 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  43.64 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 136 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3886  XRE family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 210 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03570  hypothetical protein  34.21 
 
 		 224 aa  45.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.874392  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2769  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 276 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 146 aa  44.7  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6754  transcriptional regulator, XRE family  35.94 
 
 		 210 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36173  normal  0.846385 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2414  hypothetical protein  35.09 
 
 		 155 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.478977  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4610  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 252 aa  44.3  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.985679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1927  hypothetical protein  33.85 
 
 		 148 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0136451 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  41.18 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  31.03 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1904  cupin region  47.62 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2501  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.342935  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3843  DNA-binding protein  35.71 
 
 		 209 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  33.72 
 
 		 163 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4274  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2075  cupin region  27.47 
 
 		 135 aa  42.4  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.626152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  35.29 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1559  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 262 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10260  cupin domain-containing protein  35.82 
 
 		 94 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.227794 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1555  putative transcriptional regulator  32.14 
 
 		 208 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.602269  normal  0.341998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2778  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.8 
 
 		 128 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.492542  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0062  transcriptional regulator  32.73 
 
 		 211 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2403  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.03 
 
 		 332 aa  41.6  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  39.19 
 
 		 152 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1488  cupin 2 domain-containing protein  36.51 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00804045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  40.35 
 
 		 135 aa  41.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  32.93 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2852  cupin 2  35.63 
 
 		 156 aa  41.2  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1009  cupin family protein  29.55 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.11 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  35.63 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7013  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.53 
 
 		 118 aa  41.2  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0842  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 318 aa  40.8  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.404534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  30.95 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  30.95 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.438384  normal  0.13585 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0477  XRE family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 204 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.566181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 153 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.471134  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5027  protein of unknown function DUF861 cupin_3  36.11 
 
 		 117 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.838844 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7505  hypothetical protein  38.67 
 
 		 117 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>