155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1491 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  100 
 
 		 133 aa  264  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  65.41 
 
 		 133 aa  172  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  69.23 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.12 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  57.48 
 
 		 129 aa  147  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.03 
 
 		 132 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  56.76 
 
 		 141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  58.65 
 
 		 137 aa  127  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  51.3 
 
 		 135 aa  120  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  40.23 
 
 		 129 aa  67  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  39.81 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  32.06 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.11 
 
 		 141 aa  65.5  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.77 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.74 
 
 		 131 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5386  hypothetical protein  36.64 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272839  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  30.89 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0116  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  31.11 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  32.23 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  35.11 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  36.54 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  34.74 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.43 
 
 		 179 aa  58.2  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  34.65 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0588  cupin 2 domain-containing protein  34.46 
 
 		 173 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00966189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4181  cupin 2, barrel  37.5 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4247  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4403  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707936  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  35.4 
 
 		 171 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  30.12 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  48.33 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  35.2 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  31.3 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.3 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  32.26 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  32.97 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 149 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.69 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0274  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  39.74 
 
 		 111 aa  52.4  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  32.12 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.1 
 
 		 173 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4002  cupin 2 protein  33.33 
 
 		 126 aa  51.2  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  37.74 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  31.39 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  31.39 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  37.38 
 
 		 138 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  32.03 
 
 		 156 aa  50.4  0.000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  29.85 
 
 		 157 aa  50.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  33 
 
 		 318 aa  50.1  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  32.26 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.18 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  33 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.18 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  38.46 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  33.7 
 
 		 152 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.62 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2094  transcriptional regulator Cro/CI family protein  34.12 
 
 		 188 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  30.11 
 
 		 135 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  31.18 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  31.33 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0432  cupin region  41.94 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.583729  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.9 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.54 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  30.3 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  36.47 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.1 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4136  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.64 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.12 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  29.06 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  36.19 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0812  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.74 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379382  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0833  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.73 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  29.23 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 192 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  39.58 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  32 
 
 		 150 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0483  cupin 2 domain-containing protein  28.81 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  42 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  34.83 
 
 		 147 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 311 aa  43.9  0.0006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.9 
 
 		 139 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  33.09 
 
 		 137 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 234 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2685  cupin 2 domain-containing protein  38.16 
 
 		 134 aa  43.5  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477579  hitchhiker  0.0004758 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  30.91 
 
 		 141 aa  43.9  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  38.18 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  32.35 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  30.39 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>