74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4530 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 140 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.99 
 
 		 140 aa  193  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.14 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0116  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 136 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  44.23 
 
 		 127 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  39.42 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  39.42 
 
 		 127 aa  83.6  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.42 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5386  hypothetical protein  45.1 
 
 		 127 aa  82.8  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272839  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  36.76 
 
 		 135 aa  80.5  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  35.4 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  41.51 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.86 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  35.29 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  32.06 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  34.12 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.71 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  29.41 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  32.38 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  31 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  34.18 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  28.46 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.76 
 
 		 112 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.08 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  38.75 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3105  cupin 2 domain-containing protein  37.04 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 137 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2189  cupin 2 domain-containing protein  32.91 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.525757  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000921  putative pectin degradation protein  30.38 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2840  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.97 
 
 		 118 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.862394  normal  0.202643 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 		 113 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.58 
 
 		 113 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  36.23 
 
 		 135 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  43.33 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  28.28 
 
 		 133 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1227  transcriptional regulator  47.76 
 
 		 220 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.222447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.26 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  31.33 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  29.93 
 
 		 148 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3553  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0257  cupin 2 domain-containing protein  34.65 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3283  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.33 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.218569  normal  0.219448 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  28.42 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 139 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2268  cupin 2 domain-containing protein  36.25 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.84 
 
 		 133 aa  42  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.89 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.7 
 
 		 139 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  38.03 
 
 		 145 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  26.8 
 
 		 133 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1663  cupin 2, barrel  29.17 
 
 		 159 aa  41.6  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 189 aa  41.6  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  31.07 
 
 		 318 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  31.13 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 184 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0780  cupin 2 domain-containing protein  27.85 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 207 aa  41.2  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.33 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8499800000000002e-33 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4890  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.59 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.625882 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.21 
 
 		 135 aa  40.4  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.95 
 
 		 113 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3670  cupin 2 domain-containing protein  26.44 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183912  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2934  cupin 2 domain-containing protein  38.71 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  36.21 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5786  cupin 2 conserved barrel domain protein  36.49 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.242076  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  36.14 
 
 		 218 aa  40  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 292 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>