89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5435 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  294  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  72.18 
 
 		 145 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  68.5 
 
 		 134 aa  180  6e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  57.14 
 
 		 135 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60 
 
 		 136 aa  123  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4585  hypothetical protein  72.41 
 
 		 75 aa  99  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  38.2 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5303  hypothetical protein  60 
 
 		 57 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.542043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  33.01 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.63 
 
 		 173 aa  61.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  34.07 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.07 
 
 		 135 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  32.67 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  30.77 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  37.36 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  35.16 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  30.58 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  39.24 
 
 		 318 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  36.26 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.47 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  35.16 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  38.75 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  33.67 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  34.62 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  32.22 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  34.69 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  32.97 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.56 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  33.04 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  34.07 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  38.75 
 
 		 140 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  31.87 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.12 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.04 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.04 
 
 		 150 aa  50.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.8 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  36.11 
 
 		 137 aa  48.9  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  33.67 
 
 		 138 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  30.11 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  31.46 
 
 		 157 aa  49.3  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4921  hypothetical protein  63.64 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.55042  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5010  hypothetical protein  63.64 
 
 		 57 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  32.26 
 
 		 129 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  32.29 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  32.58 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  32.18 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  34.25 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.71 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.39 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  28.07 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  28.07 
 
 		 139 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  35.23 
 
 		 137 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  30.69 
 
 		 171 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  28.7 
 
 		 139 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.3 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  39.77 
 
 		 157 aa  44.3  0.0006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.47 
 
 		 231 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.13 
 
 		 129 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  29.63 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.67 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  35.8 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 		 143 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  30 
 
 		 127 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.01 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 137 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  24.78 
 
 		 141 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.82 
 
 		 138 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  29.58 
 
 		 127 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  29.91 
 
 		 137 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.62 
 
 		 179 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 178 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  31.88 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  31.88 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  31.88 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  31.88 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  31.88 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  31.88 
 
 		 179 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  29.58 
 
 		 127 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  30.59 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  31.88 
 
 		 236 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  31.88 
 
 		 236 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 128 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.7 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  31.87 
 
 		 133 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>