84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4460 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 140 aa  283  5e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  58.99 
 
 		 140 aa  193  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.03 
 
 		 141 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0116  cupin 2 domain-containing protein  40.29 
 
 		 136 aa  114  5e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  45.71 
 
 		 127 aa  97.4  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  41.9 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  40.34 
 
 		 127 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5386  hypothetical protein  40.87 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272839  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  34.35 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  37.5 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.11 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.7 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  34.09 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  35.64 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  37.11 
 
 		 129 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.01 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  40.24 
 
 		 141 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  28.15 
 
 		 135 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  31.78 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  34.31 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  27.88 
 
 		 135 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.98 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  28.7 
 
 		 133 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  30.23 
 
 		 143 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  28.7 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.33 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.55 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  29.32 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  32.14 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.65 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  29.1 
 
 		 139 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  34.12 
 
 		 155 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7186  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.5 
 
 		 109 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  27.17 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4890  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.03 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.625882 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  34.15 
 
 		 318 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0847  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 116 aa  47  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2699  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145082  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  36.71 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.12 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1426  hypothetical protein  30.95 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416507  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.43 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  41.03 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  32.94 
 
 		 152 aa  44.3  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.15 
 
 		 137 aa  43.9  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1026  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29 
 
 		 120 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.208422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.38 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2041  cupin 2 domain-containing protein  30.12 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.267736 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  30.56 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1504  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.03 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.220487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  34.18 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  31.82 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  28.99 
 
 		 138 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  33.33 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 172 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 173 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1595  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.47 
 
 		 123 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.040843 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11503  putative pectin degradation protein  27.47 
 
 		 130 aa  42  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.380023  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  22.46 
 
 		 141 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.5 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  23.64 
 
 		 171 aa  41.2  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  30.63 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  27.5 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  29.17 
 
 		 155 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1782  anti-ECFsigma factor, ChrR  32.95 
 
 		 234 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336195  normal  0.05616 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.67 
 
 		 231 aa  40.8  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0586  anti-ECFsigma factor, ChrR  33.33 
 
 		 222 aa  40.8  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  23.02 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1603  cupin 2 domain-containing protein  44 
 
 		 87 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.664487  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  25.83 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  29.79 
 
 		 138 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  30.3 
 
 		 141 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>