69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1742 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  100 
 
 
141 aa  285  2e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  91.89 
 
 
139 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  91.89 
 
 
139 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  93.58 
 
 
139 aa  209  1e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  73.76 
 
 
140 aa  201  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  47.89 
 
 
146 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  52.54 
 
 
152 aa  114  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  50.85 
 
 
318 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  50.86 
 
 
133 aa  110  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  50 
 
 
155 aa  110  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  50.86 
 
 
133 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  52.43 
 
 
138 aa  104  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  45.86 
 
 
138 aa  104  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  53.27 
 
 
150 aa  102  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  47.9 
 
 
138 aa  101  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  50.49 
 
 
138 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.21 
 
 
139 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  50.98 
 
 
147 aa  96.3  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  49.06 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  43.27 
 
 
150 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 
144 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  36.43 
 
 
143 aa  90.5  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 
139 aa  90.1  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  42.54 
 
 
138 aa  89.4  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  45.45 
 
 
137 aa  89  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  34.59 
 
 
134 aa  87.8  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  38.33 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  38.89 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  41.94 
 
 
141 aa  85.5  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  42.86 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  38.68 
 
 
157 aa  83.6  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  34.33 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 
141 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.05 
 
 
129 aa  82  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.52 
 
 
137 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.15 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.17 
 
 
138 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  42.59 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.98 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  35.61 
 
 
135 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.57 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  45.05 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  38.83 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  41.94 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.17 
 
 
138 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.09 
 
 
135 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.32 
 
 
172 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  36.89 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.03 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  45.26 
 
 
143 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  35.92 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  35.92 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  35.92 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  32.38 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.83 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.83 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 
137 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  30.63 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.33 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  36.78 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  29.63 
 
 
145 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.03 
 
 
231 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  31.85 
 
 
148 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  37.84 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.03 
 
 
136 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>