76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B1425 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  100 
 
 		 143 aa  291  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  74.83 
 
 		 143 aa  221  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  60.75 
 
 		 138 aa  135  2e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  59.46 
 
 		 147 aa  134  4e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  58.88 
 
 		 138 aa  134  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  58.88 
 
 		 138 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  59.81 
 
 		 138 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  48.59 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  49.64 
 
 		 137 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  55.14 
 
 		 138 aa  123  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.72 
 
 		 144 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  50.82 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.66 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.34 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.05 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.05 
 
 		 150 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.4 
 
 		 137 aa  114  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.18 
 
 		 138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  51.69 
 
 		 145 aa  108  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  50.49 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  50.96 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 138 aa  104  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.51 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.54 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  51.72 
 
 		 133 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  36.57 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  49.43 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.74 
 
 		 172 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.17 
 
 		 129 aa  83.6  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.54 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  35.71 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  38.18 
 
 		 135 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  36.54 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.6 
 
 		 139 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  39.05 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  39.18 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  47.13 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  47.13 
 
 		 139 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  39.42 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.34 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  45.26 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  47.13 
 
 		 139 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.55 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.73 
 
 		 139 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  38.18 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  39.18 
 
 		 135 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  42.55 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  38.18 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  36.36 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  37.23 
 
 		 155 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  37.27 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  37.23 
 
 		 318 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  36.73 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  33.65 
 
 		 152 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.22 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  39.36 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  33.68 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  32.67 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  31.73 
 
 		 150 aa  54.7  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  30.95 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.15 
 
 		 173 aa  52.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4890  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.08 
 
 		 134 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.625882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  28.7 
 
 		 134 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2564  pirin domain-containing protein  40 
 
 		 247 aa  43.5  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.216137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2664  pirin domain-containing protein  37.5 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0801192  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0205  pirin domain-containing protein  38.03 
 
 		 231 aa  43.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  31.06 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3013  pirin domain-containing protein  36.11 
 
 		 236 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 231 aa  40.8  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3320  hypothetical protein  36.11 
 
 		 173 aa  40.4  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3156  pirin domain-containing protein  35.21 
 
 		 236 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00697726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2998  pirin domain-containing protein  35.21 
 
 		 236 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  34.52 
 
 		 135 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  29.76 
 
 		 136 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>