81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0735 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 178 aa  363  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  37.04 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  30.89 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.95 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  36.14 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  31.78 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  38.67 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 132 aa  53.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  32.48 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.56 
 
 		 128 aa  52.8  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  34.26 
 
 		 134 aa  50.8  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.13 
 
 		 139 aa  49.7  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  43.4 
 
 		 141 aa  49.7  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  27.82 
 
 		 134 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  30.6 
 
 		 135 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  43.4 
 
 		 141 aa  47.8  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.08 
 
 		 139 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.16 
 
 		 131 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  29.77 
 
 		 127 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  29.25 
 
 		 134 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  30.19 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.55 
 
 		 173 aa  45.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.07 
 
 		 174 aa  45.4  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.35 
 
 		 172 aa  45.1  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.52 
 
 		 134 aa  45.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.76 
 
 		 135 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  31.4 
 
 		 127 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4890  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.61 
 
 		 134 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.625882 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 136 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 138 aa  44.7  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  30.83 
 
 		 127 aa  44.3  0.0009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.33 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  28.3 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  28.3 
 
 		 134 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.74 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  28.3 
 
 		 131 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  30.93 
 
 		 133 aa  43.5  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  23.23 
 
 		 132 aa  43.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  39.62 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  30 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 136 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.18 
 
 		 140 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  31.06 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  30 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.85 
 
 		 134 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1623  hypothetical protein  40.74 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1740  cupin 2 domain-containing protein  36.21 
 
 		 135 aa  43.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0958  double-stranded beta-helix-like protein  30.95 
 
 		 90 aa  43.1  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000430893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1084  double-stranded beta-helix-like protein  40.68 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0476655  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  32.35 
 
 		 135 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  26.61 
 
 		 146 aa  42.4  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  36.21 
 
 		 135 aa  42.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  28.57 
 
 		 318 aa  42.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  28.72 
 
 		 134 aa  42.7  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  41.51 
 
 		 167 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5864  gentisate 1,2-dioxygenase  38.18 
 
 		 348 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0945  hypothetical protein  35.9 
 
 		 111 aa  42  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0114637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.74 
 
 		 135 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2627  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  38.18 
 
 		 348 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000696095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4526  putative gentisate 1,2-dioxygenase (MhbD)  38.18 
 
 		 348 aa  42  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000670904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  28.57 
 
 		 138 aa  42  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.78 
 
 		 165 aa  42  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  43.64 
 
 		 147 aa  42  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  25.69 
 
 		 146 aa  42  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4442  gentisate 1,2-dioxygenase  38.18 
 
 		 348 aa  42  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.772688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  37.74 
 
 		 136 aa  41.6  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5302  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.54 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  28.97 
 
 		 145 aa  41.2  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  28.21 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  26.92 
 
 		 137 aa  41.2  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  37.74 
 
 		 136 aa  41.2  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  28.89 
 
 		 134 aa  41.2  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.45 
 
 		 134 aa  41.2  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726576  normal  0.0347651 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  26.21 
 
 		 155 aa  40.8  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 138 aa  40.8  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3139  hypothetical protein  37.7 
 
 		 135 aa  40.8  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>