144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3587 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 134 aa  274  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726576  normal  0.0347651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  85.07 
 
 		 134 aa  240  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.55 
 
 		 131 aa  107  8.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  51 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  43.31 
 
 		 134 aa  104  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  55.81 
 
 		 136 aa  104  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  42.74 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  55.81 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.9 
 
 		 140 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  41.96 
 
 		 135 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  54.84 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.88 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.55 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  44 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  43.55 
 
 		 133 aa  101  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.76 
 
 		 131 aa  101  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.44 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  56.1 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  53.49 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  41.59 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  56.98 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.86 
 
 		 131 aa  100  7e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.13 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46 
 
 		 135 aa  100  9e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.88 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  42.37 
 
 		 135 aa  98.6  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  53.33 
 
 		 130 aa  97.8  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  40.16 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.96 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.94 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  48.45 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.45 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  44 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  51.16 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  46 
 
 		 171 aa  94.4  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.13 
 
 		 131 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  43.64 
 
 		 156 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  42.11 
 
 		 132 aa  94  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.42 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  43.81 
 
 		 140 aa  92.4  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  39.29 
 
 		 134 aa  91.7  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  41.28 
 
 		 179 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 149 aa  88.2  3e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  51.22 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  39 
 
 		 131 aa  87.4  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  44 
 
 		 162 aa  87  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.1 
 
 		 137 aa  87  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  39.2 
 
 		 387 aa  87  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  41.58 
 
 		 141 aa  86.3  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.2 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  47.56 
 
 		 298 aa  85.9  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.64 
 
 		 165 aa  85.1  3e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  33.59 
 
 		 398 aa  84.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  35.96 
 
 		 167 aa  84.7  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  37.4 
 
 		 164 aa  84  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  35.07 
 
 		 162 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 		 141 aa  84  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  37.84 
 
 		 138 aa  83.6  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  40.59 
 
 		 141 aa  83.6  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  46.59 
 
 		 238 aa  83.6  8e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  38 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  43.21 
 
 		 145 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.56 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.6 
 
 		 165 aa  82.4  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2099  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  34.68 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  43.68 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.34 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  34.59 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.19 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0768  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.24 
 
 		 151 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113865  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.85 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  33.09 
 
 		 141 aa  80.9  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.1 
 
 		 164 aa  80.5  0.000000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.6 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1948  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161363 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  38 
 
 		 276 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  41.84 
 
 		 105 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.8 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  45.12 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  35.43 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3410  cupin 2 domain-containing protein  41.13 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  33.87 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.56 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  37.1 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  36.51 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  40.24 
 
 		 396 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  39.05 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1080  hypothetical protein  33.91 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001033  hypothetical protein  33.91 
 
 		 166 aa  74.3  0.0000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24670  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  37.5 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  36.21 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 		 156 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  35.59 
 
 		 136 aa  72.4  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1740  cupin 2 domain-containing protein  37.74 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>