138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4635 on replicon NC_013745
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 
135 aa  279  8.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.09 
 
 
131 aa  199  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  72.09 
 
 
132 aa  194  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  68.99 
 
 
131 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  68.99 
 
 
132 aa  190  5e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.54 
 
 
131 aa  189  8e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  68.99 
 
 
132 aa  189  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  68.99 
 
 
135 aa  187  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  67.44 
 
 
142 aa  184  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  67.44 
 
 
131 aa  183  7e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  65.89 
 
 
171 aa  182  9e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  67.44 
 
 
131 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  64.66 
 
 
134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  67.44 
 
 
132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  68.99 
 
 
133 aa  180  5.0000000000000004e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  65.89 
 
 
131 aa  179  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  66.67 
 
 
131 aa  179  1e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.34 
 
 
131 aa  179  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.34 
 
 
131 aa  178  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  68.22 
 
 
132 aa  179  2e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  68.22 
 
 
132 aa  178  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.91 
 
 
140 aa  176  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.89 
 
 
131 aa  176  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.31 
 
 
131 aa  174  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  63.57 
 
 
131 aa  174  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.41 
 
 
137 aa  173  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.24 
 
 
131 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.65 
 
 
133 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  61.54 
 
 
136 aa  171  3.9999999999999995e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  62.88 
 
 
141 aa  169  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.31 
 
 
131 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  58.02 
 
 
276 aa  165  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.65 
 
 
133 aa  165  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  56.92 
 
 
387 aa  164  5e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.24 
 
 
131 aa  162  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  58.59 
 
 
157 aa  161  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  58.91 
 
 
134 aa  161  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  60.47 
 
 
156 aa  160  4.0000000000000004e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  56.72 
 
 
136 aa  159  1e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  61.24 
 
 
136 aa  158  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  60.47 
 
 
136 aa  158  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  58.91 
 
 
133 aa  157  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  56.59 
 
 
135 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  57.36 
 
 
164 aa  155  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.23 
 
 
158 aa  155  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  58.91 
 
 
131 aa  154  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  56.59 
 
 
131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  53.85 
 
 
162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.14 
 
 
158 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  55.81 
 
 
298 aa  153  6e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  55.04 
 
 
135 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  55.81 
 
 
141 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.79 
 
 
164 aa  150  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  55.47 
 
 
141 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.06 
 
 
157 aa  150  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  52.59 
 
 
135 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.81 
 
 
135 aa  148  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  53.49 
 
 
134 aa  147  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.62 
 
 
134 aa  147  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.94 
 
 
163 aa  145  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.2 
 
 
165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  52.71 
 
 
156 aa  145  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  51.94 
 
 
156 aa  142  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  51.94 
 
 
156 aa  142  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  53.08 
 
 
132 aa  142  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  51.94 
 
 
133 aa  141  3e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  53.08 
 
 
179 aa  140  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  52.03 
 
 
167 aa  140  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  53.49 
 
 
158 aa  136  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  47.29 
 
 
398 aa  134  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1415  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 
219 aa  134  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  49.58 
 
 
396 aa  131  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  51.64 
 
 
170 aa  130  6e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.54 
 
 
149 aa  130  6e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.46 
 
 
174 aa  130  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  47.69 
 
 
162 aa  129  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1080  hypothetical protein  48.41 
 
 
164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001033  hypothetical protein  47.24 
 
 
166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  48.84 
 
 
153 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  57.39 
 
 
403 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  46.92 
 
 
238 aa  125  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  47.29 
 
 
145 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.33 
 
 
143 aa  121  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.5 
 
 
134 aa  120  5e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  54.29 
 
 
268 aa  120  5e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2099  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.23 
 
 
136 aa  118  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  50.86 
 
 
138 aa  119  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.25 
 
 
165 aa  114  5e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.88 
 
 
141 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  54.9 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  48.46 
 
 
136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  45 
 
 
134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.73 
 
 
260 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.76271  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  52.14 
 
 
130 aa  110  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  44.19 
 
 
135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  42.98 
 
 
141 aa  106  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24670  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  45.38 
 
 
138 aa  104  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.37 
 
 
137 aa  103  6e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0768  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.09 
 
 
151 aa  102  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113865  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46 
 
 
134 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726576  normal  0.0347651 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>