144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3098 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 
131 aa  269  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  80.92 
 
 
158 aa  226  8e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  80.92 
 
 
131 aa  217  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  76.92 
 
 
132 aa  209  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  69.47 
 
 
156 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  67.69 
 
 
131 aa  184  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  65.89 
 
 
164 aa  179  8.000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  67.18 
 
 
131 aa  179  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  64.12 
 
 
387 aa  178  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.12 
 
 
131 aa  177  5.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  64.12 
 
 
171 aa  176  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  65.12 
 
 
132 aa  176  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.65 
 
 
158 aa  175  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  66.41 
 
 
141 aa  174  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.12 
 
 
131 aa  174  4e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.62 
 
 
131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.34 
 
 
140 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.02 
 
 
131 aa  169  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  63.08 
 
 
141 aa  169  9e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  64.62 
 
 
134 aa  168  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.54 
 
 
131 aa  167  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.54 
 
 
131 aa  167  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  65.04 
 
 
298 aa  167  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  63.57 
 
 
136 aa  166  8e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  61.54 
 
 
131 aa  164  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  61.07 
 
 
132 aa  163  8e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.91 
 
 
137 aa  163  9e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.54 
 
 
133 aa  162  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  62.02 
 
 
136 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.31 
 
 
133 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.79 
 
 
132 aa  161  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60 
 
 
157 aa  160  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  59.54 
 
 
131 aa  160  5.0000000000000005e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  58.14 
 
 
131 aa  160  6e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  60.47 
 
 
132 aa  160  8.000000000000001e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  59.69 
 
 
276 aa  159  9e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  61.24 
 
 
131 aa  159  9e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  60.47 
 
 
142 aa  159  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  57.36 
 
 
141 aa  159  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  62.02 
 
 
132 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  58.91 
 
 
134 aa  159  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  59.54 
 
 
158 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.69 
 
 
164 aa  158  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  59.69 
 
 
132 aa  157  4e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  54.26 
 
 
156 aa  157  7e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  54.26 
 
 
156 aa  157  7e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60 
 
 
131 aa  156  8e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  59.23 
 
 
131 aa  155  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  59.69 
 
 
135 aa  155  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  54.96 
 
 
398 aa  155  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.91 
 
 
135 aa  154  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  59.23 
 
 
133 aa  154  3e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.14 
 
 
131 aa  154  5.0000000000000005e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  62.02 
 
 
133 aa  154  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  53.49 
 
 
156 aa  154  5.0000000000000005e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  57.02 
 
 
396 aa  153  7e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  52.71 
 
 
157 aa  152  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  57.69 
 
 
136 aa  151  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  55.38 
 
 
162 aa  152  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.87 
 
 
165 aa  151  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.08 
 
 
163 aa  151  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  52.71 
 
 
167 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  54.62 
 
 
136 aa  147  4e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  56.49 
 
 
179 aa  147  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  54.62 
 
 
162 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  55.38 
 
 
135 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  52.71 
 
 
133 aa  144  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  54.26 
 
 
135 aa  141  3e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  53.49 
 
 
135 aa  141  4e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1415  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.77 
 
 
219 aa  139  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  51.91 
 
 
170 aa  137  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  48.84 
 
 
145 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  48.84 
 
 
134 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  53.85 
 
 
403 aa  131  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.82 
 
 
174 aa  131  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.04 
 
 
135 aa  130  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  48.85 
 
 
153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.38 
 
 
134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1080  hypothetical protein  49.21 
 
 
164 aa  127  6e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.91 
 
 
165 aa  126  8.000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  60.4 
 
 
105 aa  126  9.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  43.51 
 
 
238 aa  124  6e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  50 
 
 
268 aa  120  6e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001033  hypothetical protein  46.09 
 
 
166 aa  120  9e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.44 
 
 
149 aa  118  3e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  46.72 
 
 
135 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  47.11 
 
 
134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  47.46 
 
 
138 aa  113  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.28 
 
 
134 aa  112  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.63 
 
 
143 aa  111  3e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1321  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.56 
 
 
139 aa  105  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.185757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  42.11 
 
 
141 aa  104  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.13 
 
 
189 aa  100  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1727  hypothetical protein  39.53 
 
 
139 aa  100  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2099  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.62 
 
 
136 aa  100  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  42.98 
 
 
140 aa  100  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  43.97 
 
 
143 aa  100  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  42.86 
 
 
141 aa  100  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  42.11 
 
 
141 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  41.18 
 
 
135 aa  99.8  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>