141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0148 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  100 
 
 		 130 aa  263  5e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  56.1 
 
 		 136 aa  125  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  56.2 
 
 		 134 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  54.17 
 
 		 135 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  52.42 
 
 		 132 aa  123  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  56.1 
 
 		 135 aa  123  1e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  53.54 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  51.16 
 
 		 132 aa  120  5e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.62 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.46 
 
 		 131 aa  120  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  52.07 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  56.35 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  53.66 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  50.77 
 
 		 135 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  56.67 
 
 		 142 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.62 
 
 		 131 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  52.5 
 
 		 134 aa  117  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  47.33 
 
 		 134 aa  117  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  52.89 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.5 
 
 		 135 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.39 
 
 		 137 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  48.03 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  50.38 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.24 
 
 		 131 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.37 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  50.38 
 
 		 141 aa  114  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.24 
 
 		 131 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  51.22 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  51.26 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.26 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2099  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.8 
 
 		 136 aa  113  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  53.72 
 
 		 131 aa  113  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.79 
 
 		 131 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.26 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  48.03 
 
 		 140 aa  111  3e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  53.85 
 
 		 131 aa  111  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.81 
 
 		 131 aa  112  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.14 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.19 
 
 		 143 aa  110  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.07 
 
 		 140 aa  110  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.21 
 
 		 131 aa  110  8.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  47.11 
 
 		 138 aa  110  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  49.19 
 
 		 131 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.21 
 
 		 141 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.48 
 
 		 131 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  48.84 
 
 		 143 aa  108  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.88 
 
 		 174 aa  107  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  48.39 
 
 		 387 aa  107  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 141 aa  107  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.48 
 
 		 131 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  49.59 
 
 		 136 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.54 
 
 		 163 aa  106  9.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  50 
 
 		 171 aa  105  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.45 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  45.59 
 
 		 131 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  49.17 
 
 		 167 aa  103  7e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.76 
 
 		 137 aa  103  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0768  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.11 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113865  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.59 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.79 
 
 		 165 aa  101  3e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  48.15 
 
 		 156 aa  101  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  50 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  44.09 
 
 		 141 aa  100  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  44.7 
 
 		 396 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  42.97 
 
 		 398 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.7 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1740  cupin 2 domain-containing protein  44.35 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  45.45 
 
 		 135 aa  100  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  48.36 
 
 		 276 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3410  cupin 2 domain-containing protein  47.27 
 
 		 126 aa  99  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  45.31 
 
 		 136 aa  98.6  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.97 
 
 		 158 aa  99  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.2 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.58 
 
 		 134 aa  98.6  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.33 
 
 		 134 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.726576  normal  0.0347651 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  42.52 
 
 		 141 aa  97.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  45.38 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  48.7 
 
 		 133 aa  96.7  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  47.97 
 
 		 298 aa  95.9  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1321  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.25 
 
 		 139 aa  96.3  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.185757 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  49.52 
 
 		 105 aa  95.9  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  49.59 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  43.61 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24670  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  47.01 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3286  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.26 
 
 		 134 aa  95.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5800  cupin 2 domain-containing protein  42.5 
 
 		 131 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449659  normal  0.120253 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3249  cupin 2 domain-containing protein  42.4 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.07 
 
 		 149 aa  94.4  5e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.36 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1948  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.32 
 
 		 161 aa  94  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161363 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.46 
 
 		 158 aa  94  7e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  47.46 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3276  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.64 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 135 aa  92  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0979  hypothetical protein  43.24 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.591804 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2968  cupin 2 domain-containing protein  43.64 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2716  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.22 
 
 		 143 aa  91.3  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  50.94 
 
 		 268 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.86 
 
 		 165 aa  91.3  4e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>