141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2281 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  100 
 
 		 171 aa  347  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  78.46 
 
 		 131 aa  218  3e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  77.86 
 
 		 131 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  78.29 
 
 		 140 aa  217  5e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  76.38 
 
 		 131 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  74.42 
 
 		 131 aa  208  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  70.8 
 
 		 142 aa  204  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  72.87 
 
 		 131 aa  204  6e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  75.19 
 
 		 133 aa  202  2e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  75.19 
 
 		 132 aa  201  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  75.38 
 
 		 133 aa  200  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  74.42 
 
 		 132 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  72.09 
 
 		 135 aa  198  3e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  72.09 
 
 		 131 aa  198  3.9999999999999996e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  71.32 
 
 		 132 aa  198  3.9999999999999996e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  70.99 
 
 		 131 aa  197  7.999999999999999e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  67.94 
 
 		 131 aa  196  9e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.54 
 
 		 131 aa  195  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  69.23 
 
 		 132 aa  194  4.0000000000000005e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  71.32 
 
 		 134 aa  192  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  68.46 
 
 		 132 aa  192  3e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  69.77 
 
 		 131 aa  191  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.87 
 
 		 131 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  67.44 
 
 		 131 aa  189  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  66.92 
 
 		 137 aa  188  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  66.92 
 
 		 132 aa  186  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.39 
 
 		 158 aa  186  1e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  55 
 
 		 276 aa  185  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  66.67 
 
 		 131 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  68.22 
 
 		 131 aa  185  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  69.77 
 
 		 141 aa  185  3e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.5 
 
 		 164 aa  185  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  57.05 
 
 		 387 aa  184  4e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  70.08 
 
 		 131 aa  184  5e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.89 
 
 		 135 aa  183  8e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  65.89 
 
 		 136 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  65.12 
 
 		 136 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  59.12 
 
 		 164 aa  181  4.0000000000000006e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  63.57 
 
 		 298 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  64.12 
 
 		 136 aa  177  4e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.12 
 
 		 157 aa  178  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  64.89 
 
 		 156 aa  177  4.999999999999999e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  68.22 
 
 		 133 aa  177  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  64.12 
 
 		 131 aa  177  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  63.57 
 
 		 134 aa  176  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.86 
 
 		 158 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  52.8 
 
 		 162 aa  175  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  61.54 
 
 		 136 aa  174  6e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  64.57 
 
 		 131 aa  171  5e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  62.02 
 
 		 135 aa  169  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  61.24 
 
 		 132 aa  170  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  63.28 
 
 		 141 aa  169  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.12 
 
 		 133 aa  169  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  49.11 
 
 		 167 aa  168  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.72 
 
 		 165 aa  167  6e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1415  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.77 
 
 		 219 aa  165  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  60.47 
 
 		 135 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  49.69 
 
 		 157 aa  164  5.9999999999999996e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  59.09 
 
 		 179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.46 
 
 		 163 aa  163  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  57.36 
 
 		 134 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  55.38 
 
 		 133 aa  161  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  51.97 
 
 		 170 aa  160  6e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  56.59 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  56.59 
 
 		 156 aa  160  6e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  57.25 
 
 		 158 aa  160  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  54.55 
 
 		 398 aa  159  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.47 
 
 		 135 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  55.81 
 
 		 156 aa  158  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  57.58 
 
 		 396 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  56.59 
 
 		 135 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  50.31 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.15 
 
 		 134 aa  152  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  57.48 
 
 		 141 aa  151  4e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  51.88 
 
 		 145 aa  147  5e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  64.35 
 
 		 403 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  48.73 
 
 		 153 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1080  hypothetical protein  42.42 
 
 		 164 aa  144  5e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.25 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.67 
 
 		 134 aa  135  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  58.65 
 
 		 105 aa  131  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  48.06 
 
 		 238 aa  127  5.0000000000000004e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.24 
 
 		 149 aa  127  9.000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.29 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.83 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001033  hypothetical protein  44.09 
 
 		 166 aa  121  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  47.5 
 
 		 134 aa  118  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  48.36 
 
 		 135 aa  117  6e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  50.41 
 
 		 268 aa  117  6e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2099  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.06 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  50 
 
 		 130 aa  107  1e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.2 
 
 		 141 aa  106  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2716  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.28 
 
 		 143 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  45.08 
 
 		 136 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24670  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  44 
 
 		 138 aa  103  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1727  hypothetical protein  39.84 
 
 		 139 aa  102  3e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  37.07 
 
 		 141 aa  101  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  42.61 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  38.79 
 
 		 140 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>