139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35570 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  217  5e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  66.67 
 
 		 276 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  64.42 
 
 		 158 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.53 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  63.73 
 
 		 164 aa  140  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  65.69 
 
 		 156 aa  139  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.05 
 
 		 131 aa  138  3e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.21 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  64.42 
 
 		 153 aa  137  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.73 
 
 		 131 aa  137  7e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.95 
 
 		 158 aa  136  7.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.71 
 
 		 131 aa  136  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  62.75 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.58 
 
 		 131 aa  133  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.08 
 
 		 140 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  58.65 
 
 		 387 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  59.8 
 
 		 133 aa  130  5e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  61.39 
 
 		 132 aa  130  5e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  65 
 
 		 131 aa  130  5e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  58.65 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  68.13 
 
 		 298 aa  130  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.22 
 
 		 158 aa  130  9e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1415  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.8 
 
 		 219 aa  129  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  61.76 
 
 		 136 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  62.75 
 
 		 131 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.38 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  61.17 
 
 		 131 aa  127  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  61.39 
 
 		 132 aa  127  5.0000000000000004e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  60.78 
 
 		 136 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  60.78 
 
 		 132 aa  127  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  60.4 
 
 		 131 aa  126  9.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  61.96 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  61.76 
 
 		 162 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.78 
 
 		 137 aa  125  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.78 
 
 		 131 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  56.86 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.65 
 
 		 163 aa  125  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  62.75 
 
 		 135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  58.25 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  58.25 
 
 		 156 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  57.84 
 
 		 141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  61.76 
 
 		 179 aa  124  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  57.84 
 
 		 133 aa  123  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  58.82 
 
 		 134 aa  123  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  58.82 
 
 		 134 aa  123  9e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  58.25 
 
 		 156 aa  122  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.25 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.28 
 
 		 133 aa  122  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.81 
 
 		 131 aa  120  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  59.8 
 
 		 142 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  57.84 
 
 		 131 aa  120  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.54 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.77 
 
 		 133 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  59.22 
 
 		 133 aa  120  8e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  60.19 
 
 		 132 aa  120  9e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.82 
 
 		 131 aa  120  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.84 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.82 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  60 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.86 
 
 		 165 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  55.88 
 
 		 132 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  55.88 
 
 		 132 aa  115  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  56.25 
 
 		 134 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  58.33 
 
 		 136 aa  114  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  53.61 
 
 		 398 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  57.29 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  58.95 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  51.55 
 
 		 396 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.9 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.8 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  56.25 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  56.82 
 
 		 134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  53.92 
 
 		 170 aa  110  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  51.96 
 
 		 131 aa  110  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  55.88 
 
 		 403 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.51 
 
 		 174 aa  107  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.81 
 
 		 165 aa  107  5e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  49.02 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  52.08 
 
 		 268 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.49 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  54.74 
 
 		 135 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.55 
 
 		 137 aa  100  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.55 
 
 		 134 aa  99.8  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1727  hypothetical protein  48.54 
 
 		 139 aa  97.4  5e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.54 
 
 		 149 aa  97.4  5e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3139  hypothetical protein  45.37 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  49.52 
 
 		 130 aa  95.9  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2020  cupin 2, barrel  48.54 
 
 		 178 aa  96.7  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0745737  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  42.86 
 
 		 141 aa  95.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001033  hypothetical protein  48.08 
 
 		 166 aa  94.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  49.45 
 
 		 143 aa  94.4  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  46.6 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1321  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.83 
 
 		 139 aa  94.4  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.185757 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001030  RmlC-type cupin  47.31 
 
 		 148 aa  94  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  47.25 
 
 		 140 aa  94  7e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1080  hypothetical protein  45.63 
 
 		 164 aa  93.6  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  40.62 
 
 		 238 aa  93.2  1e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18470  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  45.74 
 
 		 143 aa  90.9  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0851583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.32 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>