134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2020 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2020  cupin 2, barrel  100 
 
 		 178 aa  370  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0745737  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  42.45 
 
 		 157 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1727  hypothetical protein  48.7 
 
 		 139 aa  111  6e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001033  hypothetical protein  42.22 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.78 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1080  hypothetical protein  40 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.7 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.55 
 
 		 131 aa  104  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  39.71 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  48.21 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  46.96 
 
 		 132 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.05 
 
 		 165 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  44.83 
 
 		 276 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.96 
 
 		 131 aa  102  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  33.54 
 
 		 167 aa  101  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  36.94 
 
 		 387 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 171 aa  100  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  44.07 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  44.14 
 
 		 156 aa  99.8  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  47.71 
 
 		 156 aa  99.4  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.54 
 
 		 135 aa  99  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  42.24 
 
 		 132 aa  99  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  44.14 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  44.14 
 
 		 156 aa  98.2  5e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.54 
 
 		 131 aa  98.2  6e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  43.97 
 
 		 298 aa  97.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1415  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.6 
 
 		 219 aa  97.4  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  43.97 
 
 		 131 aa  97.4  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 142 aa  96.7  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  40 
 
 		 398 aa  97.1  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  44.86 
 
 		 131 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.74 
 
 		 157 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  48.54 
 
 		 105 aa  96.7  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.23 
 
 		 131 aa  95.9  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  46.43 
 
 		 131 aa  95.5  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  45.3 
 
 		 131 aa  94.7  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.55 
 
 		 131 aa  94.7  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.22 
 
 		 164 aa  95.1  5e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.09 
 
 		 158 aa  94.7  6e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  43.48 
 
 		 132 aa  94.4  7e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.59 
 
 		 131 aa  94.4  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.38 
 
 		 131 aa  93.6  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  43.86 
 
 		 136 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  44.04 
 
 		 136 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  41.38 
 
 		 134 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.79 
 
 		 131 aa  92.8  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  43.97 
 
 		 141 aa  92.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.62 
 
 		 140 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  44.92 
 
 		 131 aa  92  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  40.57 
 
 		 133 aa  91.7  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.65 
 
 		 137 aa  91.7  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  36.02 
 
 		 396 aa  91.7  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  43.48 
 
 		 141 aa  91.7  6e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  41.67 
 
 		 134 aa  90.5  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.95 
 
 		 133 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.87 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  41.03 
 
 		 132 aa  90.9  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  45.1 
 
 		 135 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  43.97 
 
 		 135 aa  90.1  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.75 
 
 		 165 aa  89.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  42.24 
 
 		 132 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.22 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.24 
 
 		 132 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  40.68 
 
 		 158 aa  89  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  41.74 
 
 		 132 aa  88.6  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.34 
 
 		 133 aa  88.2  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 135 aa  87.8  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  40.17 
 
 		 145 aa  87  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  40.74 
 
 		 131 aa  87  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  42.24 
 
 		 133 aa  87  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  51.11 
 
 		 268 aa  86.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  39.83 
 
 		 133 aa  86.3  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.35 
 
 		 131 aa  86.3  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  46.3 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  41.74 
 
 		 153 aa  85.9  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.2 
 
 		 131 aa  85.1  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  40.87 
 
 		 141 aa  85.1  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  43.14 
 
 		 135 aa  84.3  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  39.34 
 
 		 138 aa  84.3  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  39.47 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  41.59 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  39.47 
 
 		 136 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.59 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.79 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.31 
 
 		 137 aa  80.5  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  42.16 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  40.87 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  38.79 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2716  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1948  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.36 
 
 		 161 aa  77.4  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161363 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3139  hypothetical protein  38.35 
 
 		 135 aa  77  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  35.29 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  41.76 
 
 		 143 aa  77  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  35.46 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  43.48 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  35.38 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  36.52 
 
 		 141 aa  73.9  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  36.15 
 
 		 141 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0253836 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>