234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3211 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 403 aa  824    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  60.43 
 
 		 387 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3979  Carboxymuconolactone decarboxylase  60.09 
 
 		 252 aa  285  9e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.22073  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3793  Carboxymuconolactone decarboxylase  50.85 
 
 		 233 aa  246  4e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0130032  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2947  Carboxymuconolactone decarboxylase  55.07 
 
 		 244 aa  230  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.045535 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001032  hypothetical protein  50.97 
 
 		 238 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1079  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  50.48 
 
 		 244 aa  211  2e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3258  carboxymuconolactone decarboxylase  48 
 
 		 263 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00392422  normal  0.0442906 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3786  carboxymuconolactone decarboxylase  51.72 
 
 		 262 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.310289 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3140  hypothetical protein  45.54 
 
 		 241 aa  191  2e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  33.43 
 
 		 396 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5749  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.08 
 
 		 221 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  31.42 
 
 		 398 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  42.31 
 
 		 298 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1002  Carboxymuconolactone decarboxylase  40.64 
 
 		 428 aa  167  4e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.593653 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.9 
 
 		 137 aa  164  3e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  64.35 
 
 		 171 aa  164  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.39 
 
 		 131 aa  162  7e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  61.98 
 
 		 131 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.17 
 
 		 131 aa  160  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  60 
 
 		 156 aa  160  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  65.52 
 
 		 276 aa  159  9e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  58.73 
 
 		 162 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  52.45 
 
 		 164 aa  157  2e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.25 
 
 		 131 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.2 
 
 		 131 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.36 
 
 		 140 aa  155  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  57.03 
 
 		 136 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.68 
 
 		 158 aa  155  2e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  57.25 
 
 		 134 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.5 
 
 		 131 aa  153  5e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  55.81 
 
 		 134 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.92 
 
 		 158 aa  152  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  55.73 
 
 		 132 aa  152  1e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  56.9 
 
 		 132 aa  152  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  62.61 
 
 		 136 aa  151  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.14 
 
 		 132 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.66 
 
 		 131 aa  150  4e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  56.59 
 
 		 131 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  52.31 
 
 		 133 aa  150  5e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  53.85 
 
 		 131 aa  150  6e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  61.86 
 
 		 141 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  61.74 
 
 		 131 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  58.41 
 
 		 156 aa  149  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  58.41 
 
 		 156 aa  149  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  53.03 
 
 		 142 aa  149  9e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.47 
 
 		 165 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  57.36 
 
 		 132 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.26 
 
 		 131 aa  148  2.0000000000000003e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  59.13 
 
 		 132 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  57.52 
 
 		 156 aa  146  5e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  57.76 
 
 		 131 aa  146  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  60.36 
 
 		 158 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  54.26 
 
 		 132 aa  146  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.93 
 
 		 131 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  61.21 
 
 		 135 aa  145  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  54.26 
 
 		 132 aa  145  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1415  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.74 
 
 		 219 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.85 
 
 		 131 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  60 
 
 		 133 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  53.28 
 
 		 141 aa  144  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  55.83 
 
 		 131 aa  142  7e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  56.03 
 
 		 131 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.39 
 
 		 135 aa  141  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.88 
 
 		 164 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  56.3 
 
 		 136 aa  139  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.13 
 
 		 157 aa  138  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  52.03 
 
 		 157 aa  137  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.52 
 
 		 133 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.72 
 
 		 163 aa  135  9e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  52.31 
 
 		 179 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  57.26 
 
 		 133 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  51.69 
 
 		 167 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  48.09 
 
 		 170 aa  133  5e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.85 
 
 		 133 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  54.24 
 
 		 135 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  47.66 
 
 		 141 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.59 
 
 		 131 aa  129  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  48.84 
 
 		 135 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  51.35 
 
 		 153 aa  126  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  49.62 
 
 		 162 aa  126  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.31 
 
 		 134 aa  126  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  51.72 
 
 		 136 aa  126  7e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.79 
 
 		 165 aa  125  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  50.86 
 
 		 134 aa  125  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  52.54 
 
 		 135 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  55.88 
 
 		 105 aa  123  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.25 
 
 		 134 aa  121  3e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.07 
 
 		 135 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  50.43 
 
 		 145 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0875  carboxymuconolactone decarboxylase  44.59 
 
 		 168 aa  119  9e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00171869  hitchhiker  0.0000000007488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1080  hypothetical protein  40.6 
 
 		 164 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 174 aa  110  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  40.94 
 
 		 238 aa  109  7.000000000000001e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  52.38 
 
 		 268 aa  109  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  46.43 
 
 		 134 aa  109  1e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1948  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.8 
 
 		 161 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161363 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001033  hypothetical protein  40.43 
 
 		 166 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  44.72 
 
 		 135 aa  109  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.22 
 
 		 143 aa  108  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>