140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1697 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 179 aa  360  5.0000000000000005e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  73.85 
 
 		 162 aa  202  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  62.41 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  59.09 
 
 		 171 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  59.54 
 
 		 158 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.49 
 
 		 131 aa  155  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.91 
 
 		 131 aa  155  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  58.27 
 
 		 276 aa  153  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.49 
 
 		 131 aa  151  5e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.64 
 
 		 164 aa  151  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  56.59 
 
 		 131 aa  150  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.02 
 
 		 131 aa  149  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  57.36 
 
 		 132 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.06 
 
 		 131 aa  149  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  57.58 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.82 
 
 		 158 aa  149  3e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.69 
 
 		 131 aa  148  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  52.71 
 
 		 133 aa  148  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  56.49 
 
 		 131 aa  147  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  53.91 
 
 		 162 aa  147  9e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  53.38 
 
 		 387 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  55.81 
 
 		 136 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.81 
 
 		 131 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.82 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.06 
 
 		 140 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  56.49 
 
 		 142 aa  145  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  54.26 
 
 		 133 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.14 
 
 		 131 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  54.26 
 
 		 136 aa  145  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.36 
 
 		 157 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  58.14 
 
 		 135 aa  144  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  56.06 
 
 		 132 aa  144  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  56.92 
 
 		 141 aa  144  6e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.81 
 
 		 131 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  55.97 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.38 
 
 		 158 aa  143  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  56.59 
 
 		 131 aa  143  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.59 
 
 		 131 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  48.75 
 
 		 298 aa  142  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  55.04 
 
 		 132 aa  142  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  55.04 
 
 		 132 aa  141  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.81 
 
 		 137 aa  141  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.71 
 
 		 131 aa  141  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.08 
 
 		 135 aa  140  7e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  57.36 
 
 		 133 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1415  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.79 
 
 		 219 aa  137  7e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  52.67 
 
 		 131 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  58.26 
 
 		 141 aa  137  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  54.26 
 
 		 132 aa  136  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  48.97 
 
 		 157 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  46 
 
 		 398 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  52.71 
 
 		 132 aa  134  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  50.39 
 
 		 134 aa  134  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  44.19 
 
 		 167 aa  134  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.71 
 
 		 163 aa  133  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  53.49 
 
 		 131 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  53.49 
 
 		 134 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  44.16 
 
 		 396 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  50.76 
 
 		 153 aa  128  6e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  48.84 
 
 		 131 aa  127  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  46.51 
 
 		 156 aa  126  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  46.51 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  46.51 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.76 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  47.15 
 
 		 145 aa  125  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  61.76 
 
 		 105 aa  124  6e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.75 
 
 		 133 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  50 
 
 		 136 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  48.84 
 
 		 135 aa  122  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.16 
 
 		 133 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  52.63 
 
 		 135 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.51 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  52.31 
 
 		 403 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.83 
 
 		 165 aa  119  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  49.14 
 
 		 134 aa  118  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.15 
 
 		 134 aa  117  9e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  47.69 
 
 		 136 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.18 
 
 		 149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  50.88 
 
 		 135 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.75 
 
 		 135 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  44.96 
 
 		 141 aa  111  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1080  hypothetical protein  44.44 
 
 		 164 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.97 
 
 		 143 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  43.9 
 
 		 268 aa  105  3e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001033  hypothetical protein  42.52 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.97 
 
 		 134 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  42.28 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  40.77 
 
 		 141 aa  102  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.09 
 
 		 189 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  101  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  44.44 
 
 		 140 aa  101  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  41.09 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  42.74 
 
 		 143 aa  98.6  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1948  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.36 
 
 		 161 aa  97.8  7e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161363 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2099  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 136 aa  97.1  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1623  hypothetical protein  45.22 
 
 		 135 aa  95.5  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1727  hypothetical protein  39.06 
 
 		 139 aa  95.5  4e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  39.55 
 
 		 138 aa  95.5  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3139  hypothetical protein  44.74 
 
 		 135 aa  94.7  6e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.2 
 
 		 255 aa  94.7  6e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0201167 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>