138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2716 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2716  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 143 aa  289  7e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.2 
 
 		 143 aa  143  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 		 141 aa  123  6e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24670  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  50.43 
 
 		 138 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  47.97 
 
 		 135 aa  111  3e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2099  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.79 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.21 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20530  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  48.82 
 
 		 134 aa  110  6e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0506039  normal  0.197478 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  48.28 
 
 		 134 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  44.35 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  46.03 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  49.15 
 
 		 135 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  48.28 
 
 		 136 aa  108  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  47.93 
 
 		 135 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3276  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.36 
 
 		 135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.57 
 
 		 131 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  48.72 
 
 		 136 aa  105  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 171 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.8 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  47.41 
 
 		 134 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  48.28 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  49.15 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  51.79 
 
 		 136 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  46.28 
 
 		 162 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.15 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1080  hypothetical protein  47.86 
 
 		 164 aa  103  8e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  49.14 
 
 		 132 aa  103  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.41 
 
 		 140 aa  102  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  46.55 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.22 
 
 		 174 aa  101  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.74 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.46 
 
 		 149 aa  100  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.01 
 
 		 157 aa  100  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  47.46 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.55 
 
 		 133 aa  99.4  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001033  hypothetical protein  45 
 
 		 166 aa  99  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.86 
 
 		 164 aa  99  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.54 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7206  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.04 
 
 		 260 aa  98.2  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.76271  normal  0.799003 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  42.86 
 
 		 133 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  45.16 
 
 		 276 aa  98.6  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  46.03 
 
 		 141 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  46.55 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.55 
 
 		 133 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1415  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.8 
 
 		 219 aa  97.4  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  44.83 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.46 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  43.55 
 
 		 164 aa  97.1  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  48.31 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.56 
 
 		 135 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.69 
 
 		 132 aa  96.7  9e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  45.3 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  40.6 
 
 		 387 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  45.3 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  44.17 
 
 		 134 aa  95.9  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  44.92 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.01 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  46.15 
 
 		 156 aa  94.7  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 162 aa  95.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  46.55 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  44.83 
 
 		 142 aa  94.4  5e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  41.88 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  41.88 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  41.88 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.07 
 
 		 131 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  46.55 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  46.55 
 
 		 134 aa  93.6  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.83 
 
 		 135 aa  93.6  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.41 
 
 		 158 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.3 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  42.15 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  44.83 
 
 		 158 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.3 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.37 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  44.92 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.83 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  43.22 
 
 		 130 aa  91.3  5e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  41.88 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  44.17 
 
 		 298 aa  90.1  9e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  40.94 
 
 		 170 aa  90.1  9e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  41.53 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  41.94 
 
 		 179 aa  89.7  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.38 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3410  cupin 2 domain-containing protein  43.52 
 
 		 126 aa  88.2  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  43.86 
 
 		 141 aa  88.2  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  43.44 
 
 		 403 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.22 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  42.24 
 
 		 396 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  44.14 
 
 		 398 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.17 
 
 		 189 aa  84.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  38.66 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.17 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1948  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 161 aa  82.4  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161363 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.01 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  40.34 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.38 
 
 		 165 aa  80.1  0.000000000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  46.23 
 
 		 268 aa  80.1  0.000000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>