139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0776 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  100 
 
 		 141 aa  293  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  82.98 
 
 		 140 aa  241  3e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  78.01 
 
 		 141 aa  231  3e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  77.3 
 
 		 141 aa  231  3e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  65.71 
 
 		 137 aa  197  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  65.03 
 
 		 143 aa  194  3e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  58.16 
 
 		 138 aa  178  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3139  hypothetical protein  60.77 
 
 		 135 aa  153  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1321  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.9 
 
 		 139 aa  153  6e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.185757 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  56.59 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1740  cupin 2 domain-containing protein  56.59 
 
 		 135 aa  147  6e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.04 
 
 		 138 aa  145  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1623  hypothetical protein  52.9 
 
 		 135 aa  142  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1084  double-stranded beta-helix-like protein  50.35 
 
 		 148 aa  142  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0476655  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001030  RmlC-type cupin  54.96 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.41 
 
 		 255 aa  139  9.999999999999999e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18470  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  51.72 
 
 		 143 aa  135  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0851583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0768  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.64 
 
 		 151 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113865  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1948  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.97 
 
 		 161 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161363 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0426  hypothetical protein  51.54 
 
 		 131 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.56 
 
 		 189 aa  120  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.14 
 
 		 163 aa  115  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0958  double-stranded beta-helix-like protein  58.24 
 
 		 90 aa  116  9.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000430893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  48.03 
 
 		 130 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0945  hypothetical protein  54.95 
 
 		 111 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0114637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  38.81 
 
 		 387 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  47.83 
 
 		 167 aa  114  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.61 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  47.83 
 
 		 157 aa  110  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  42.97 
 
 		 276 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 174 aa  109  1.0000000000000001e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.22 
 
 		 165 aa  107  7.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.98 
 
 		 135 aa  106  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  41.23 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  41.23 
 
 		 132 aa  104  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  45.61 
 
 		 132 aa  105  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  42.11 
 
 		 131 aa  104  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.52 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 142 aa  104  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.68 
 
 		 158 aa  104  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.47 
 
 		 131 aa  103  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.87 
 
 		 164 aa  104  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.35 
 
 		 137 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.23 
 
 		 132 aa  103  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.58 
 
 		 165 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  41.23 
 
 		 132 aa  103  9e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  40.71 
 
 		 133 aa  103  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  43.36 
 
 		 156 aa  103  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  39.32 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  41.88 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.52 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 179 aa  101  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  37.07 
 
 		 171 aa  101  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.98 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  40.16 
 
 		 135 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  41.23 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  42.11 
 
 		 135 aa  100  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.96 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 131 aa  100  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.71 
 
 		 131 aa  100  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  38.14 
 
 		 162 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.82 
 
 		 131 aa  99  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  42.4 
 
 		 162 aa  99  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  39.66 
 
 		 153 aa  99  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.66 
 
 		 398 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  39.82 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  40.35 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  41.23 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  33.83 
 
 		 133 aa  98.6  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  42.11 
 
 		 135 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 131 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  38.94 
 
 		 141 aa  97.8  5e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  39.2 
 
 		 134 aa  97.8  5e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.37 
 
 		 135 aa  97.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.71 
 
 		 131 aa  97.8  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 		 133 aa  97.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  36.72 
 
 		 396 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  41.23 
 
 		 136 aa  96.7  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  42.24 
 
 		 131 aa  96.7  9e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  40.52 
 
 		 158 aa  96.7  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  38.46 
 
 		 135 aa  96.3  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.17 
 
 		 149 aa  96.3  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  42.34 
 
 		 164 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.26 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.94 
 
 		 140 aa  95.1  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  42.86 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  41.23 
 
 		 136 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  36.09 
 
 		 298 aa  95.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  37.39 
 
 		 170 aa  94.7  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  38.94 
 
 		 141 aa  94.4  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.52 
 
 		 134 aa  94  7e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  36.5 
 
 		 268 aa  93.2  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5800  cupin 2 domain-containing protein  39.34 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449659  normal  0.120253 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.17 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  36.52 
 
 		 134 aa  92  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.39 
 
 		 131 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.39 
 
 		 133 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>