136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001030 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001030  RmlC-type cupin  100 
 
 		 148 aa  310  4.999999999999999e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3139  hypothetical protein  68.94 
 
 		 135 aa  204  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1321  Cupin 2 conserved barrel domain protein  70.87 
 
 		 139 aa  189  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.185757 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  57.46 
 
 		 255 aa  166  9e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18470  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  58.52 
 
 		 143 aa  154  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0851583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  54.96 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  55.73 
 
 		 140 aa  140  7e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  53.44 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.22 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  51.91 
 
 		 141 aa  128  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1623  hypothetical protein  54.69 
 
 		 135 aa  127  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  52.27 
 
 		 143 aa  125  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0945  hypothetical protein  61.62 
 
 		 111 aa  122  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0114637  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0426  hypothetical protein  50.77 
 
 		 131 aa  122  2e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  47.24 
 
 		 138 aa  113  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0958  double-stranded beta-helix-like protein  57.61 
 
 		 90 aa  111  3e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000430893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.62 
 
 		 138 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1740  cupin 2 domain-containing protein  44.96 
 
 		 135 aa  104  3e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1084  double-stranded beta-helix-like protein  47.66 
 
 		 148 aa  103  6e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0476655  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  44.25 
 
 		 134 aa  103  1e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  43.41 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.54 
 
 		 158 aa  101  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  42.62 
 
 		 387 aa  99.8  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  43.94 
 
 		 157 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  46.49 
 
 		 131 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 132 aa  97.4  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  43.48 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  43.97 
 
 		 134 aa  97.1  7e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.22 
 
 		 133 aa  95.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.22 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.98 
 
 		 174 aa  95.1  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  44.35 
 
 		 131 aa  94.4  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.22 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  47.31 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.15 
 
 		 165 aa  94  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.48 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.35 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  41.41 
 
 		 135 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  47.83 
 
 		 164 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  48.35 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  45.61 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  43.48 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  41.74 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.45 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.48 
 
 		 132 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  45.22 
 
 		 142 aa  91.7  3e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.35 
 
 		 137 aa  92  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.55 
 
 		 164 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  41.67 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.37 
 
 		 158 aa  90.9  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.61 
 
 		 133 aa  90.9  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.22 
 
 		 157 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.92 
 
 		 163 aa  90.9  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  43.8 
 
 		 141 aa  90.5  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  45.65 
 
 		 276 aa  90.1  9e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  45.22 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  41.07 
 
 		 238 aa  90.1  9e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  46.9 
 
 		 130 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  42.24 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  42.24 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  41.38 
 
 		 298 aa  89  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.48 
 
 		 131 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  51.69 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  40.68 
 
 		 132 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  41.74 
 
 		 136 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  39.69 
 
 		 135 aa  88.2  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  43.48 
 
 		 167 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  45.65 
 
 		 153 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  40.34 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.74 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  40.62 
 
 		 135 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1948  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.77 
 
 		 161 aa  86.3  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161363 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  42.61 
 
 		 133 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0768  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.86 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113865  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.98 
 
 		 131 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.86 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  41.23 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  44.35 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  46.07 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 		 162 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3249  cupin 2 domain-containing protein  37.69 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  42.7 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  40.83 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  42.61 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.17 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.62 
 
 		 135 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.59 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3410  cupin 2 domain-containing protein  38.46 
 
 		 126 aa  84  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  40.68 
 
 		 133 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  42.11 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  46.15 
 
 		 162 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0979  hypothetical protein  36.92 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.591804 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  40.87 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.52 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.17 
 
 		 189 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  40.35 
 
 		 141 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  38.02 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  39.62 
 
 		 268 aa  81.3  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  42.39 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>