More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_1806 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  100 
 
 		 255 aa  526  1e-149  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18470  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  62.5 
 
 		 143 aa  179  5.999999999999999e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0851583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3139  hypothetical protein  63.08 
 
 		 135 aa  175  8e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1321  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.42 
 
 		 139 aa  173  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.185757 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001030  RmlC-type cupin  57.46 
 
 		 148 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  38.52 
 
 		 398 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  41.86 
 
 		 298 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1910  carboxymuconolactone decarboxylase  66.02 
 
 		 106 aa  149  5e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  36.4 
 
 		 396 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01020  uncharacterized protein, gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit like protein  64.76 
 
 		 108 aa  145  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.141102 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  51.41 
 
 		 141 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1085  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  62.38 
 
 		 105 aa  138  8.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0564788  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  50.74 
 
 		 141 aa  135  8e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  50.71 
 
 		 140 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  53.03 
 
 		 141 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1625  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  61.39 
 
 		 104 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0425  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  62.38 
 
 		 105 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf083  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  57.69 
 
 		 108 aa  125  5e-28  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0224766  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1623  hypothetical protein  48.94 
 
 		 135 aa  125  6e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.52 
 
 		 137 aa  122  7e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1084  double-stranded beta-helix-like protein  48.18 
 
 		 148 aa  122  7e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0476655  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0426  hypothetical protein  48.46 
 
 		 131 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  45.83 
 
 		 143 aa  118  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0958  double-stranded beta-helix-like protein  56.38 
 
 		 90 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000430893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0945  hypothetical protein  54.29 
 
 		 111 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0114637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2114  Carboxymuconolactone decarboxylase  50.5 
 
 		 107 aa  108  9.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000414856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4122  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.96 
 
 		 107 aa  108  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.847034 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  45.8 
 
 		 138 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3046  carboxymuconolactone decarboxylase  52.08 
 
 		 106 aa  104  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44 
 
 		 174 aa  102  5e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  31.65 
 
 		 387 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.79 
 
 		 138 aa  101  9e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2469  Carboxymuconolactone decarboxylase  46.3 
 
 		 138 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.799907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  44.64 
 
 		 276 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2194  carboxymuconolactone decarboxylase  46.88 
 
 		 140 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2482  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.88 
 
 		 140 aa  97.8  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000156087  normal  0.0594202 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2086  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  46.88 
 
 		 140 aa  97.8  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000641307  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2707  gamma-carboxymuconolactone decarboxylase subunit-like protein  48.42 
 
 		 139 aa  97.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1740  cupin 2 domain-containing protein  40.32 
 
 		 135 aa  97.4  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 136 aa  96.7  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2039  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46 
 
 		 107 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.202589  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  40.32 
 
 		 135 aa  95.9  6e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0521  carboxymuconolactone decarboxylase  48.04 
 
 		 108 aa  95.5  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00160379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.28 
 
 		 165 aa  95.5  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2018  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.31 
 
 		 107 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0370669  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  39.02 
 
 		 162 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  39.2 
 
 		 179 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  41.94 
 
 		 134 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_003296  RS03072  4-carboxymuconolactone decarboxylase protein  47.66 
 
 		 108 aa  93.2  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  40 
 
 		 133 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1757  4-carboxymuconolactone decarboxylase  46 
 
 		 107 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  41.53 
 
 		 134 aa  93.6  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32360  Carboxymuconolactone decarboxylase protein  45.65 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1459  carboxymuconolactone decarboxylase  44.66 
 
 		 105 aa  93.2  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.917437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.46 
 
 		 131 aa  92.8  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  40.26 
 
 		 167 aa  92.4  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5713  Carboxymuconolactone decarboxylase  44 
 
 		 107 aa  92  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1975  4-carboxymuconolactone decarboxylase  45 
 
 		 107 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.05823e-17 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.92 
 
 		 131 aa  91.7  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  38.58 
 
 		 170 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1800  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.37 
 
 		 103 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2144  carboxymuconolactone decarboxylase  48.42 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000390984 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1940  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  47.37 
 
 		 103 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  42.24 
 
 		 131 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  41.46 
 
 		 142 aa  90.9  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  42.14 
 
 		 157 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  41.46 
 
 		 158 aa  90.9  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5463  carboxymuconolactone decarboxylase  45.36 
 
 		 110 aa  90.9  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0245296  normal  0.0559461 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  45.92 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.5 
 
 		 132 aa  90.1  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1752  carboxymuconolactone decarboxylase  47.78 
 
 		 102 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00315461  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.37 
 
 		 157 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  39.5 
 
 		 132 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  41.88 
 
 		 130 aa  89.7  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.08 
 
 		 165 aa  89.7  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.22 
 
 		 163 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.22 
 
 		 131 aa  88.6  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1948  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.86 
 
 		 161 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161363 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  40.68 
 
 		 131 aa  87.8  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  41.03 
 
 		 136 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  41.67 
 
 		 132 aa  87  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.46 
 
 		 158 aa  87.4  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.62 
 
 		 158 aa  87  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0843  carboxymuconolactone decarboxylase  46.32 
 
 		 259 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.536951  normal  0.096524 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  38.58 
 
 		 136 aa  86.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 171 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0608  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.58 
 
 		 99 aa  85.9  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.34 
 
 		 137 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  43.16 
 
 		 153 aa  85.9  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  34.55 
 
 		 162 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.41 
 
 		 164 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  39.85 
 
 		 156 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  40.19 
 
 		 105 aa  84.7  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.83 
 
 		 131 aa  85.1  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  39.17 
 
 		 135 aa  84.3  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  38.66 
 
 		 132 aa  84.7  0.000000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3089  carboxymuconolactone decarboxylase  38.89 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  38.66 
 
 		 132 aa  84  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  35.67 
 
 		 164 aa  84  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  47.42 
 
 		 132 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>