136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0958 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0958  double-stranded beta-helix-like protein  100 
 
 		 90 aa  189  8e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000430893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3139  hypothetical protein  61.29 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18470  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  58.95 
 
 		 143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0851583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  58.24 
 
 		 141 aa  116  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  56.38 
 
 		 255 aa  116  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  57.14 
 
 		 140 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1623  hypothetical protein  57.14 
 
 		 135 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1321  Cupin 2 conserved barrel domain protein  57.61 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.185757 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001030  RmlC-type cupin  57.61 
 
 		 148 aa  111  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1084  double-stranded beta-helix-like protein  58.14 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0476655  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  55.32 
 
 		 143 aa  109  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  57.14 
 
 		 141 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0426  hypothetical protein  55.56 
 
 		 131 aa  107  5e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.85 
 
 		 137 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  54.95 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  53.93 
 
 		 138 aa  100  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.27 
 
 		 138 aa  98.2  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0945  hypothetical protein  70.97 
 
 		 111 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0114637  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.83 
 
 		 158 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  45.45 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.45 
 
 		 132 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  45.56 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  48.86 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.31 
 
 		 174 aa  87.8  4e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  45.56 
 
 		 179 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  49.43 
 
 		 130 aa  86.7  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.07 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  42.39 
 
 		 387 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1740  cupin 2 domain-containing protein  48.86 
 
 		 135 aa  85.9  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.59 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.56 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  44.94 
 
 		 162 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  48.86 
 
 		 135 aa  84.3  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 171 aa  84  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.44 
 
 		 131 aa  84  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  47.73 
 
 		 136 aa  84  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  43.18 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.45 
 
 		 131 aa  84  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.73 
 
 		 165 aa  83.6  8e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.56 
 
 		 131 aa  83.6  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.45 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  47.73 
 
 		 132 aa  82.8  0.000000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  46.07 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  46.67 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  45.45 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.32 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  45.45 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  46.07 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1948  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.11 
 
 		 161 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161363 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  46.59 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  43.33 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  46.59 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.56 
 
 		 163 aa  81.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.16 
 
 		 165 aa  81.3  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  42.22 
 
 		 158 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.32 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  44.32 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  45.45 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  45.45 
 
 		 105 aa  80.9  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.94 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  45.45 
 
 		 298 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.56 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.11 
 
 		 398 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.18 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  42.86 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0979  hypothetical protein  40.48 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.591804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  40.91 
 
 		 133 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  44.83 
 
 		 141 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  43.18 
 
 		 135 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  42.05 
 
 		 136 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  41.57 
 
 		 162 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  39.77 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.32 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  43.18 
 
 		 276 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  43.18 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.33 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0768  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.83 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113865  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5800  cupin 2 domain-containing protein  40.7 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449659  normal  0.120253 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  43.18 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  43.82 
 
 		 157 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  39.77 
 
 		 170 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  43.02 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  41.11 
 
 		 396 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.32 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  42.7 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  42.22 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.05 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  42.05 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  41.11 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  40.91 
 
 		 403 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  39.77 
 
 		 141 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  41.11 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  41.11 
 
 		 156 aa  73.9  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2099  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.08 
 
 		 136 aa  73.2  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  44.32 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.91 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  42.05 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  41.57 
 
 		 141 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.91 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.05 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>