139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1623 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1623  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  280  5.000000000000001e-75  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0426  hypothetical protein  64.23 
 
 		 131 aa  170  6.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3139  hypothetical protein  57.36 
 
 		 135 aa  143  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  52.9 
 
 		 141 aa  142  1e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18470  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  56.83 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0851583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1321  Cupin 2 conserved barrel domain protein  52.55 
 
 		 139 aa  137  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.185757 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  49.29 
 
 		 140 aa  134  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0945  hypothetical protein  60.19 
 
 		 111 aa  134  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0114637  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  48.92 
 
 		 141 aa  131  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1084  double-stranded beta-helix-like protein  51.56 
 
 		 148 aa  127  4.0000000000000003e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0476655  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  49.26 
 
 		 141 aa  127  6e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001030  RmlC-type cupin  54.69 
 
 		 148 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  49.26 
 
 		 137 aa  127  7.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  49.65 
 
 		 143 aa  125  1.0000000000000001e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.94 
 
 		 255 aa  125  2.0000000000000002e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  46.62 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0958  double-stranded beta-helix-like protein  57.14 
 
 		 90 aa  115  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000430893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.77 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  45.22 
 
 		 179 aa  95.5  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  39.69 
 
 		 135 aa  95.5  2e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.48 
 
 		 174 aa  95.1  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.44 
 
 		 158 aa  94.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1740  cupin 2 domain-containing protein  38.93 
 
 		 135 aa  92.8  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  45.69 
 
 		 170 aa  92  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1948  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.78 
 
 		 161 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161363 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  46.55 
 
 		 164 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  46.49 
 
 		 156 aa  90.1  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.49 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  45.22 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.24 
 
 		 165 aa  89.4  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  43.09 
 
 		 162 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0768  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.37 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113865  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  41.59 
 
 		 133 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  38.57 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.74 
 
 		 131 aa  86.7  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  43.86 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  42.74 
 
 		 387 aa  86.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  50.55 
 
 		 158 aa  86.3  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.35 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.25 
 
 		 131 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.98 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  40.71 
 
 		 171 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  44.83 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  45.13 
 
 		 136 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3249  cupin 2 domain-containing protein  42.98 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  43.86 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  44.25 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.1 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  42.86 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.35 
 
 		 158 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  43.1 
 
 		 136 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.61 
 
 		 164 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  43.86 
 
 		 136 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  42.24 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  37.68 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  39.52 
 
 		 157 aa  84  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  38.41 
 
 		 276 aa  83.6  8e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  44.25 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  44.74 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  48.91 
 
 		 105 aa  82.8  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.48 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  47.83 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.48 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  44.25 
 
 		 136 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.25 
 
 		 163 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.59 
 
 		 143 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  39.66 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.23 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  41.67 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  45.13 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.34 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5800  cupin 2 domain-containing protein  38.18 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449659  normal  0.120253 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  38.05 
 
 		 153 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.06 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0979  hypothetical protein  38.1 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.591804 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  43.48 
 
 		 162 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.96 
 
 		 189 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.35 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.87 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.23 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  37.7 
 
 		 132 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  40.16 
 
 		 135 aa  79  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1980  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.7 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  38.52 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.5 
 
 		 149 aa  78.2  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1415  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.25 
 
 		 219 aa  77.8  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  42.61 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.09 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.6 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  43.36 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1414  cupin 2 conserved barrel domain protein  41.23 
 
 		 141 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2968  cupin 2 domain-containing protein  37.84 
 
 		 135 aa  76.6  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  39.82 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  41.94 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.82 
 
 		 132 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.6 
 
 		 131 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3410  cupin 2 domain-containing protein  37.61 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4453  carboxymuconolactone decarboxylase  36.28 
 
 		 396 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0765828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  41.94 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 141 aa  75.5  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.647155 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>