139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0426 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0426  hypothetical protein  100 
 
 
131 aa  272  1.0000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1623  hypothetical protein  64.23 
 
 
135 aa  170  6.999999999999999e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1321  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.36 
 
 
139 aa  131  3e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.185757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3139  hypothetical protein  53.91 
 
 
135 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  51.54 
 
 
141 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0945  hypothetical protein  59.43 
 
 
111 aa  127  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0114637  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  50.77 
 
 
140 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001030  RmlC-type cupin  50.77 
 
 
148 aa  122  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  48.46 
 
 
255 aa  121  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  50.77 
 
 
141 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18470  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  50 
 
 
143 aa  119  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0851583  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  50 
 
 
143 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50 
 
 
137 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  47.01 
 
 
141 aa  114  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  46.88 
 
 
138 aa  113  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1084  double-stranded beta-helix-like protein  48.76 
 
 
148 aa  110  6e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0476655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0958  double-stranded beta-helix-like protein  55.56 
 
 
90 aa  107  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000430893  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1740  cupin 2 domain-containing protein  43.75 
 
 
135 aa  97.4  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.18 
 
 
138 aa  97.1  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1948  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.84 
 
 
161 aa  95.1  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.161363 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  42.97 
 
 
135 aa  94.7  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  36.69 
 
 
145 aa  93.6  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  45.61 
 
 
134 aa  92.8  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  44.25 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  44.74 
 
 
136 aa  91.7  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0768  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.55 
 
 
151 aa  90.9  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113865  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  41.13 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.87 
 
 
131 aa  87.4  5e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  43.36 
 
 
162 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  42.98 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.11 
 
 
131 aa  84.7  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.79 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  42.11 
 
 
167 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  38.79 
 
 
179 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1980  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.37 
 
 
130 aa  82.8  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 
158 aa  82.4  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.38 
 
 
163 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  41.23 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  38.94 
 
 
170 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  38.26 
 
 
131 aa  81.6  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  38.79 
 
 
171 aa  80.9  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  44.09 
 
 
153 aa  81.3  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.31 
 
 
165 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  41.07 
 
 
164 aa  80.9  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  42.11 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3249  cupin 2 domain-containing protein  38.74 
 
 
129 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  39.47 
 
 
162 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.34 
 
 
134 aa  79.3  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  46.15 
 
 
133 aa  79.7  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.91 
 
 
149 aa  79.7  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.13 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  45.56 
 
 
132 aa  79  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 
132 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  44.33 
 
 
105 aa  78.2  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.84 
 
 
165 aa  78.6  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.47 
 
 
164 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1415  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.72 
 
 
219 aa  78.2  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  37.07 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.72 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.52 
 
 
158 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 
131 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.26 
 
 
174 aa  77.4  0.00000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.19 
 
 
131 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  36.28 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  38.14 
 
 
387 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  34.96 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  40.35 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  40.21 
 
 
156 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.26 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 
135 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  46.15 
 
 
298 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  38.52 
 
 
157 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  40.21 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  40.21 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  42.27 
 
 
158 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.16 
 
 
141 aa  74.7  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.66 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  42.11 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5800  cupin 2 domain-containing protein  35.71 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449659  normal  0.120253 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.14 
 
 
157 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.98 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  41.57 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  40 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  35.61 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  39.47 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.7 
 
 
131 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  38.6 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0470  carboxymuconolactone decarboxylase  37.61 
 
 
238 aa  71.6  0.000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0123066  normal  0.044727 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.4 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.78 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.22 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  36.36 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.07 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  35.59 
 
 
398 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.78 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0979  hypothetical protein  34.58 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.591804 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  33.85 
 
 
135 aa  70.1  0.000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.26 
 
 
131 aa  69.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>