138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0945 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0945  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  231  2.0000000000000002e-60  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0114637  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1623  hypothetical protein  60.19 
 
 		 135 aa  134  4e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0426  hypothetical protein  59.43 
 
 		 131 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1321  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.59 
 
 		 139 aa  124  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.185757 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001030  RmlC-type cupin  61.62 
 
 		 148 aa  122  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3139  hypothetical protein  59.6 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  54.29 
 
 		 255 aa  114  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  54.95 
 
 		 141 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18470  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  57.14 
 
 		 143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0851583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  60.67 
 
 		 140 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  60.67 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  52.25 
 
 		 141 aa  105  2e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.77 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  51.04 
 
 		 138 aa  100  6e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  60.47 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1084  double-stranded beta-helix-like protein  50.98 
 
 		 148 aa  97.8  5e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0476655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0958  double-stranded beta-helix-like protein  70.97 
 
 		 90 aa  95.5  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000430893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.86 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  45.54 
 
 		 135 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1740  cupin 2 domain-containing protein  45.54 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  46.59 
 
 		 162 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  48.84 
 
 		 131 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.04 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.59 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  40.66 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0768  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.45 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113865  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04818  cupin domain  48.28 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.24 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  44.83 
 
 		 136 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  40.21 
 
 		 131 aa  80.9  0.000000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  46.59 
 
 		 157 aa  80.5  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 171 aa  80.1  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1948  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.16 
 
 		 161 aa  79.7  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161363 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  44.32 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.53 
 
 		 174 aa  80.1  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.32 
 
 		 132 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.43 
 
 		 140 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  45.45 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1161  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.48 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000592158  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35570  hypothetical protein  53.42 
 
 		 105 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467993  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  45.45 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.05 
 
 		 164 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.05 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  59.68 
 
 		 298 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.19 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  48.31 
 
 		 189 aa  77  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.02 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  47.06 
 
 		 156 aa  76.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.34 
 
 		 131 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.32 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  43.18 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  44.71 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  44.19 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  44.32 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  45.88 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  42.53 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.24 
 
 		 163 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  43.37 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.84 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.43 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  41 
 
 		 135 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  42.7 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  45.12 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  42 
 
 		 135 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.7 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  42.53 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  41.38 
 
 		 398 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1435  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3211  carboxymuconolactone decarboxylase  42.68 
 
 		 403 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  40.91 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  42.05 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  43.68 
 
 		 131 aa  73.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2945  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.25 
 
 		 165 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449546 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  43.02 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.94 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2800  cupin 2, barrel  42.05 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.116084  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3051  cupin 2 domain-containing protein  45.98 
 
 		 162 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4370  cupin 2 domain-containing protein  42.05 
 
 		 387 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  43.02 
 
 		 131 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.4 
 
 		 135 aa  71.6  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf082  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.04054  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4635  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.86 
 
 		 135 aa  69.7  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.05 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  39.36 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  39.36 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  39.36 
 
 		 156 aa  69.3  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  39.77 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.77 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2441  carboxymuconolactone decarboxylase  41.67 
 
 		 276 aa  68.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  41.86 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.96 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2711  hypothetical protein  40.48 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5800  cupin 2 domain-containing protein  41.18 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449659  normal  0.120253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  42.05 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  40.91 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.91 
 
 		 133 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  38.78 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>