136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3249 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_3249  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 129 aa  266  1e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3410  cupin 2 domain-containing protein  64.8 
 
 		 126 aa  174  3e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0979  hypothetical protein  62.9 
 
 		 132 aa  173  6e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.591804 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5800  cupin 2 domain-containing protein  62.9 
 
 		 131 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.449659  normal  0.120253 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2968  cupin 2 domain-containing protein  57.48 
 
 		 135 aa  159  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1795  cupin 2 domain-containing protein  44.83 
 
 		 135 aa  95.9  1e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00267571  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0880  cupin 2 domain-containing protein  44.78 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.592364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3139  hypothetical protein  42.98 
 
 		 135 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0148  cupin 2, barrel  42.4 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1740  cupin 2 domain-containing protein  42.19 
 
 		 135 aa  93.2  1e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1254  Cupin 2 conserved barrel domain protein  46.02 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.340481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2626  cupin 2, barrel  39.39 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.542859  normal  0.174872 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1345  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.13 
 
 		 133 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.960003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2638  cupin 2, barrel  39.85 
 
 		 135 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.746968  hitchhiker  0.000814118 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2830  cupin region  40.65 
 
 		 135 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.148707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0949  cupin 2 domain-containing protein  40.62 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.379941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1321  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.5 
 
 		 139 aa  89  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.185757 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.64 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2510  hypothetical protein  42.19 
 
 		 131 aa  88.6  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.179837 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0625  cupin 2 domain-containing protein  39.17 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.285367  decreased coverage  0.00129861 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6792  cupin 2 domain-containing protein  42.48 
 
 		 158 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.699759  normal  0.518208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4794  cupin 2 domain-containing protein  37.98 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4130  hypothetical protein  36.72 
 
 		 134 aa  87.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.830739 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1351  cupin 2 domain-containing protein  42.19 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.300773  normal  0.281811 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.19 
 
 		 132 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0911719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3088  cupin 2 domain-containing protein  43.48 
 
 		 162 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1084  double-stranded beta-helix-like protein  43.3 
 
 		 148 aa  87  7e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0476655  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0776  hypothetical protein  37.5 
 
 		 141 aa  86.7  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  unclonable  0.000000000433123 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1618  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.36 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1623  hypothetical protein  42.98 
 
 		 135 aa  85.5  2e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001030  RmlC-type cupin  37.69 
 
 		 148 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5693  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.54 
 
 		 131 aa  84.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791628 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0273  cupin 2 domain-containing protein  38.39 
 
 		 141 aa  85.1  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3098  cupin 2 domain-containing protein  41.44 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0926795 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3373  cupin 2 domain-containing protein  41.44 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.789757  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.21 
 
 		 131 aa  84.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.670448  hitchhiker  0.00191403 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5714  cupin 2, conserved barrel domain protein  36.43 
 
 		 134 aa  84.3  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.721902  normal  0.850928 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0405  hypothetical protein  38.81 
 
 		 132 aa  84.3  5e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6730  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.8 
 
 		 131 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0847  cupin 2 domain-containing protein  42.24 
 
 		 153 aa  84  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0541373 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6791  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 136 aa  84.3  6e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.399896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2039  cupin 2, barrel  40.35 
 
 		 136 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.454361  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2960  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.26 
 
 		 135 aa  84  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1500  cupin region  36.84 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0870616 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2195  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.5 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192313  decreased coverage  0.00112961 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2095  cupin 2 domain-containing protein  39.5 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3486  hypothetical protein  45.22 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.927106 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1460  cupin 2 domain-containing protein  38.74 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0253836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4054  cupin 2 domain-containing protein  44 
 
 		 131 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.197212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18470  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  38.46 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0851583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.6 
 
 		 141 aa  82.4  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2400  cupin 2 domain-containing protein  40.98 
 
 		 131 aa  82  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32560  Conserved hypothetical cupin family protein  43.1 
 
 		 164 aa  82.4  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157773  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0760  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  38.74 
 
 		 134 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.747507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2099  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 136 aa  81.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1980  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.74 
 
 		 130 aa  82  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2281  transcriptional regulator  38.1 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.853806 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.8 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00188967 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1135  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.2 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.28104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0655  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.29 
 
 		 398 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.47766  normal  0.236933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2270  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.84 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.0010273  normal  0.190026 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0772  hypothetical protein  37.84 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000766165 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0466  hypothetical protein  37.9 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3184  Cupin 2 conserved barrel domain protein  47.83 
 
 		 134 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.93212 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0426  hypothetical protein  38.74 
 
 		 131 aa  80.1  0.000000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2919  cupin 2 domain-containing protein  38.76 
 
 		 133 aa  80.1  0.000000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5748  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.34 
 
 		 163 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0248088  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1052  cupin 2 domain-containing protein  39.23 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.379214 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2917  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.11 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2013  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.48 
 
 		 158 aa  79.7  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.706602  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2046  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.090507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.58 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.972022  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1951  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.04 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.578106  normal  0.399763 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8338  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.36 
 
 		 157 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6145  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.89 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3850  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.64 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.226784  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2716  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.16 
 
 		 143 aa  77.8  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1954  hypothetical protein  45.22 
 
 		 298 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513058  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3255  cupin 2 domain-containing protein  38.94 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.162447  normal  0.118949 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1695  cupin 2 domain-containing protein  39.17 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38060  hypothetical protein  40.98 
 
 		 156 aa  77.4  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.96 
 
 		 174 aa  77  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3352  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.33 
 
 		 137 aa  76.6  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2866  cupin family protein  38.6 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105692  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24670  uncharacterized conserved protein, contains double-stranded beta-helix domain  38.52 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3259  cupin 2 domain-containing protein  38.05 
 
 		 167 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0115338  normal  0.0903256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1697  cupin 2 domain-containing protein  38.6 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3217  cupin 2 domain-containing protein  44.57 
 
 		 141 aa  76.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349466  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2195  cupin 2 domain-containing protein  38.39 
 
 		 156 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3909  cupin 2, barrel  36.94 
 
 		 157 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5021  cupin region  38.39 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00533136  normal  0.0498556 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2087  cupin domain-containing protein  38.39 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000586329  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1948  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.84 
 
 		 161 aa  75.5  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.161363 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2483  cupin domain-containing protein  38.39 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229564  normal  0.0414052 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1806  Carboxymuconolactone decarboxylase  39.32 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0201167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1146  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.48 
 
 		 164 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0847  hypothetical protein  37.3 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166508  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3922  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.61 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2098  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2111  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.02 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00167413 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>