56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2490 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  268  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  29.9 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  27.35 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.59 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  28.87 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  28.87 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.31 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.43 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  30.89 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  26.47 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  33.33 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.12 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.17 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  25.44 
 
 		 133 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  23.66 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.67 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  25 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  29.55 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  25.38 
 
 		 133 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  28.89 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  22.9 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  22.9 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0162  hypothetical protein  35 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.991414  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  25 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.93 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.77 
 
 		 132 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  27.78 
 
 		 318 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  28.69 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  26.85 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.26 
 
 		 172 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  37.88 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1597  hypothetical protein  30 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 173 aa  45.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  27.17 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  30.23 
 
 		 143 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  27.71 
 
 		 157 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0969  hypothetical protein  30.59 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.307514  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 137 aa  44.3  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  21.8 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.07 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  27.27 
 
 		 150 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.71 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  27.03 
 
 		 135 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  34.85 
 
 		 135 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  26.67 
 
 		 134 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  31.58 
 
 		 135 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.72 
 
 		 140 aa  41.2  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  29.81 
 
 		 138 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  30.67 
 
 		 148 aa  40.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 138 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.78 
 
 		 231 aa  40.4  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.21 
 
 		 133 aa  40  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>