66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5168 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  100 
 
 		 143 aa  292  1e-78  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  76.3 
 
 		 138 aa  192  2e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  64.71 
 
 		 139 aa  183  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  60.74 
 
 		 138 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  64.44 
 
 		 138 aa  160  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58.09 
 
 		 139 aa  160  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  62.22 
 
 		 147 aa  153  8e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  61.48 
 
 		 138 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  62.6 
 
 		 138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.76 
 
 		 143 aa  130  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.38 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  60.58 
 
 		 138 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.85 
 
 		 138 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  58 
 
 		 137 aa  121  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  50.82 
 
 		 143 aa  120  6e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  56.73 
 
 		 138 aa  120  8e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  57 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59 
 
 		 138 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  53.51 
 
 		 138 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  45.86 
 
 		 137 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  47.76 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  56.57 
 
 		 141 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.85 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.85 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  50.42 
 
 		 145 aa  100  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  41.94 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  43.93 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  44.55 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  44.55 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  44.55 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  41.67 
 
 		 155 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  39.09 
 
 		 150 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  46.74 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  37.98 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  41.67 
 
 		 318 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  41.96 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  43.96 
 
 		 150 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  41.67 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  45.65 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.59 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  36.61 
 
 		 135 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.52 
 
 		 172 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.85 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  32.84 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  32.84 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.79 
 
 		 135 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  32.43 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  32.09 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  36 
 
 		 134 aa  67  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.35 
 
 		 129 aa  65.5  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  36.84 
 
 		 134 aa  63.9  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  28.35 
 
 		 135 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  30.23 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  32.65 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  33.65 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  35.96 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  34.48 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.79 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  31.87 
 
 		 121 aa  43.9  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  25.58 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.65 
 
 		 132 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2222  DNA-binding protein  31.13 
 
 		 179 aa  40.8  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>