95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0092 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0092  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  266  7e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4626  cupin 2 domain-containing protein  89.55 
 
 
134 aa  243  9e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000448523 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  89.31 
 
 
131 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  89.31 
 
 
131 aa  237  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.418121 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  74.07 
 
 
135 aa  202  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  84.55 
 
 
139 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2420  Cupin 2 conserved barrel domain protein  71.11 
 
 
135 aa  192  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.796075 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  74.29 
 
 
134 aa  165  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60.43 
 
 
139 aa  160  6e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  67.62 
 
 
135 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  66.67 
 
 
134 aa  152  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2920  cupin 2, barrel  68.32 
 
 
134 aa  149  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.288591  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2973  hypothetical protein  63.64 
 
 
133 aa  149  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.909683  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3724  hypothetical protein  62.62 
 
 
157 aa  149  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3157  Cupin 2 conserved barrel domain protein  55.04 
 
 
129 aa  147  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.737145  normal  0.282512 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1999  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.5 
 
 
134 aa  137  7e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  40 
 
 
150 aa  92  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  40.17 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1206  hypothetical protein  40.78 
 
 
152 aa  89  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1684  cupin domain-containing protein  41.58 
 
 
155 aa  87.4  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0195  cupin domain-containing protein  40.59 
 
 
318 aa  86.7  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.579249  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1602  cupin domain-containing protein  40 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.433121  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  37.61 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6385  cupin 2 domain-containing protein  37.8 
 
 
138 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.128861 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0348  hypothetical protein  37.4 
 
 
135 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.37 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6088  cupin 2 domain-containing protein  39.42 
 
 
138 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5629  cupin 2 domain-containing protein  37.74 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5737  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.17 
 
 
139 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  35.54 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6988  cupin 2 domain-containing protein  38.83 
 
 
138 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.833985  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 
171 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3553  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  39.09 
 
 
143 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03510  hypothetical protein  38.68 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.866507  hitchhiker  0.00000000000000348857 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2274  cupin region  36.8 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.921638  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6134  cupin region  37.5 
 
 
138 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.84 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0261511  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4739  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 
137 aa  72.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.234364  normal  0.716595 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1742  hypothetical protein  36.89 
 
 
141 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0525377  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5642  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.13 
 
 
179 aa  72.4  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4282  cupin 2 domain-containing protein  38.4 
 
 
137 aa  72  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3950  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 
138 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.319807 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0995  cupin region  36 
 
 
138 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2017  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.29 
 
 
143 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0367587 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.5 
 
 
139 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5168  cupin 2, barrel  35.92 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.244444 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  34.31 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4674  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.24 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.3213  normal  0.701172 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2789  cupin 2 domain-containing protein  36.89 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4102  cupin 2, barrel  35 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.470129  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3253  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.641495  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4264  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 
139 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209517  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6168  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.26 
 
 
172 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4326  cupin 2 domain-containing protein  35 
 
 
140 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.785226  normal  0.151311 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2518  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.71 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2774  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.68 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.283614  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3402  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.78 
 
 
144 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.68 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  32.56 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1346  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.787585  hitchhiker  0.0000000363501 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1318  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 
150 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  39.13 
 
 
145 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  32.97 
 
 
145 aa  53.5  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  32.26 
 
 
133 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  30.34 
 
 
129 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.85 
 
 
140 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  28.57 
 
 
136 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2102  cupin 2 domain-containing protein  34.41 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2285  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.84 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2490  hypothetical protein  25.23 
 
 
132 aa  50.4  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440666  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08614  cupin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13620)  35.63 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5062  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.9 
 
 
136 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4486  cupin 2 domain-containing protein  38.16 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.801691  normal  0.97198 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.35 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  32.33 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  31.58 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  29.2 
 
 
137 aa  47.4  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  29.25 
 
 
178 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  31.63 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  28.41 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.89 
 
 
231 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  32.29 
 
 
141 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4890  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.625882 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.56 
 
 
149 aa  41.6  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  33.66 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2731  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.91 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.497805  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  26.8 
 
 
204 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0116  cupin 2 domain-containing protein  25.38 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1426  hypothetical protein  32.06 
 
 
130 aa  40.8  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416507  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.31 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.647155 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0925  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 
205 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  27.61 
 
 
129 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>