33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4890 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4890  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.625882 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1426  hypothetical protein  45.9 
 
 		 130 aa  105  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416507  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  38.58 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  38.4 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  34.88 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  36.29 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4002  cupin 2 protein  32.73 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.8 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.85 
 
 		 131 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0116  cupin 2 domain-containing protein  34.41 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  31.5 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  35.11 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.03 
 
 		 140 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.06 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5386  hypothetical protein  37.1 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272839  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2343  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.31 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1425  hypothetical protein  33.08 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.18183  normal  0.0452464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  27.61 
 
 		 178 aa  45.1  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  28.57 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  37.31 
 
 		 142 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.63 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  31.9 
 
 		 141 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.69 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.08 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  36.59 
 
 		 140 aa  40.8  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  26.95 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  34.45 
 
 		 133 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  34.71 
 
 		 129 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0402  bicupin, oxalate decarboxylase family  37.97 
 
 		 404 aa  40.4  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.861289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5257  cupin 2, barrel  27.07 
 
 		 131 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5602  cupin 2 domain-containing protein  27.07 
 
 		 131 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.418121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>