18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4002 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_4002  cupin 2 protein  100 
 
 		 126 aa  249  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1426  hypothetical protein  28.57 
 
 		 130 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416507  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.35 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4890  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.73 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.625882 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  36.11 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.64 
 
 		 128 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  33.33 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.07 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  31.25 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0446  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.63 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2031  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  40.62 
 
 		 478 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0272076  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2514  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 174 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0103732  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  30.86 
 
 		 123 aa  42.4  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1329  mannose-6-phosphate isomerase  28.95 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0501  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1328  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  32.22 
 
 		 472 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.358027  decreased coverage  0.000505656 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3200  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  41.07 
 
 		 512 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2890  mannose-1-phosphate guanylyltransferase/mannose-6-phosphate isomerase  32.22 
 
 		 470 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1239  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  28.57 
 
 		 472 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.79355  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>