22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1426 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1426  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  266  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416507  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4890  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.9 
 
 		 134 aa  105  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.625882 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4002  cupin 2 protein  28.57 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.31 
 
 		 132 aa  58.5  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  33.33 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  33.86 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  31.78 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  29.77 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 128 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1706  cupin 2 protein  32.28 
 
 		 136 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  32.17 
 
 		 133 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  32.79 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.62 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  27.07 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5386  hypothetical protein  34.75 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272839  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3204  cupin region  34.18 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  28.33 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 		 133 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.84 
 
 		 141 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  31.19 
 
 		 133 aa  40.4  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>