52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5386 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5386  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  252  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272839  normal  0.670212 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  63.78 
 
 		 127 aa  171  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3695  cupin region  61.9 
 
 		 127 aa  163  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  59.52 
 
 		 127 aa  160  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1779  Cupin 2 conserved barrel domain protein  66.98 
 
 		 131 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  45.1 
 
 		 140 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.87 
 
 		 140 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.6 
 
 		 141 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  40 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  45.19 
 
 		 135 aa  84  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0116  cupin 2 domain-containing protein  35.9 
 
 		 136 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.8 
 
 		 132 aa  75.1  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  41.9 
 
 		 137 aa  75.1  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.34 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  37.8 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  38.26 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.67 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2444  hypothetical protein  37.74 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.406383  normal  0.979022 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  36.64 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4890  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.1 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.625882 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5056  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0370159 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1426  hypothetical protein  34.75 
 
 		 130 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.416507  normal  0.349881 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0735  cupin 2 domain-containing protein  35.04 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4505  cupin 2 domain-containing protein  34.95 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4715  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.44 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4316  cupin 2  34.25 
 
 		 146 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.09 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5346  cupin 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 171 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0870556 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0177  cupin 2 domain-containing protein  43.08 
 
 		 148 aa  41.6  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.178476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0731  cupin 2 domain-containing protein  38 
 
 		 112 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00910188  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2388  oxalate decarboxylase  30.19 
 
 		 389 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510235 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4456  hypothetical protein  39.71 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0285903  normal  0.0443513 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5828  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6741  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5435  hypothetical protein  29.81 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.534413  normal  0.706923 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4521  hypothetical protein  38.24 
 
 		 129 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0939  hypothetical protein  37.5 
 
 		 266 aa  40.8  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4742  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000930389 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5822  cupin 2 domain-containing protein  32.03 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.186045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1503  cupin 2 domain-containing protein  29.6 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3788  cupin 2 domain-containing protein  29.92 
 
 		 133 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.140912  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1034  transcriptional regulator, XRE family  36.84 
 
 		 181 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000342515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.03 
 
 		 118 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6850  cupin 2 domain-containing protein  37.5 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 234 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3851  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.86 
 
 		 143 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0747223 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1525  oxalate decarboxylase  30.48 
 
 		 408 aa  40  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>