22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0939 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0939  hypothetical protein  100 
 
 		 266 aa  546  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0701  cupin 2 domain-containing protein  36.75 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1567  hypothetical protein  34.78 
 
 		 140 aa  63.9  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0625  cupin 2 domain-containing protein  33.63 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4635  cupin 2, barrel  34.19 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3728  cupin 2 domain-containing protein  34.19 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0858246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3793  cupin 2 domain-containing protein  34.19 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742443  normal  0.0537176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2367  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.43 
 
 		 140 aa  60.8  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.81 
 
 		 144 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800776  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.92 
 
 		 132 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0171538  hitchhiker  0.000000529343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4216  cupin 2 domain-containing protein  35.14 
 
 		 138 aa  61.2  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.014913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2754  cupin 2 domain-containing protein  34.29 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2942  hypothetical protein  32.81 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3610  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 144 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0505  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1841  cupin 2, barrel  32.58 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5798  cupin 2 domain-containing protein  35.45 
 
 		 150 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1216  cupin 2 domain-containing protein  28.03 
 
 		 145 aa  53.1  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5282  hypothetical protein  28.87 
 
 		 191 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1401  hypothetical protein  32.14 
 
 		 133 aa  47.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>