23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5282 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5282  hypothetical protein  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1401  hypothetical protein  55.12 
 
 		 133 aa  152  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0625  cupin 2 domain-containing protein  43.08 
 
 		 151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1841  cupin 2, barrel  44.09 
 
 		 141 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0505  hypothetical protein  44.76 
 
 		 133 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.28 
 
 		 132 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0171538  hitchhiker  0.000000529343 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4635  cupin 2, barrel  42.4 
 
 		 144 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3728  cupin 2 domain-containing protein  42.4 
 
 		 144 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0858246 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3610  cupin 2 domain-containing protein  42.4 
 
 		 144 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1567  hypothetical protein  42.62 
 
 		 140 aa  99.4  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3793  cupin 2 domain-containing protein  42.4 
 
 		 144 aa  99.4  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742443  normal  0.0537176 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2367  hypothetical protein  41.6 
 
 		 144 aa  97.8  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2942  hypothetical protein  40.98 
 
 		 144 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2754  cupin 2 domain-containing protein  40.98 
 
 		 141 aa  96.3  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.16 
 
 		 144 aa  95.9  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800776  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1216  cupin 2 domain-containing protein  40.3 
 
 		 145 aa  94  1e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0701  cupin 2 domain-containing protein  41.32 
 
 		 141 aa  94.4  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4216  cupin 2 domain-containing protein  40.16 
 
 		 138 aa  94  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.014913 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.98 
 
 		 140 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.93 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5798  cupin 2 domain-containing protein  38.94 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0939  hypothetical protein  28.17 
 
 		 266 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0784  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 129 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0399886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>