25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3363 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 140 aa  293  7e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1841  cupin 2, barrel  89.21 
 
 		 141 aa  260  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2754  cupin 2 domain-containing protein  86.33 
 
 		 141 aa  252  1.0000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1567  hypothetical protein  80.58 
 
 		 140 aa  241  1.9999999999999999e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3610  cupin 2 domain-containing protein  76.26 
 
 		 144 aa  223  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2367  hypothetical protein  76.98 
 
 		 144 aa  223  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2942  hypothetical protein  76.26 
 
 		 144 aa  221  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4216  cupin 2 domain-containing protein  77.7 
 
 		 138 aa  221  4e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.014913 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  75.54 
 
 		 144 aa  219  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800776  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4635  cupin 2, barrel  74.82 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3728  cupin 2 domain-containing protein  74.82 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0858246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3793  cupin 2 domain-containing protein  74.82 
 
 		 144 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742443  normal  0.0537176 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1216  cupin 2 domain-containing protein  72.99 
 
 		 145 aa  207  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0701  cupin 2 domain-containing protein  71.21 
 
 		 141 aa  207  5e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0625  cupin 2 domain-containing protein  67.63 
 
 		 151 aa  193  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815435 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.79 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0171538  hitchhiker  0.000000529343 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0505  hypothetical protein  43.7 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5282  hypothetical protein  40.98 
 
 		 191 aa  92.8  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1401  hypothetical protein  40.87 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5798  cupin 2 domain-containing protein  34.04 
 
 		 150 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.71 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0939  hypothetical protein  32.43 
 
 		 266 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0544  hypothetical protein, putative phage gene  37.14 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597495  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0784  cupin 2 domain-containing protein  26.97 
 
 		 129 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0399886  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  28.57 
 
 		 115 aa  40.4  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>