26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0625 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0625  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 151 aa  313  5e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815435 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1216  cupin 2 domain-containing protein  68.03 
 
 		 145 aa  206  1e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.365458  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3610  cupin 2 domain-containing protein  68.15 
 
 		 144 aa  194  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  67.63 
 
 		 140 aa  193  5.000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1841  cupin 2, barrel  66.91 
 
 		 141 aa  193  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2367  hypothetical protein  68.89 
 
 		 144 aa  193  6e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.577514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4635  cupin 2, barrel  68.89 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3728  cupin 2 domain-containing protein  68.89 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0858246 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3793  cupin 2 domain-containing protein  68.89 
 
 		 144 aa  192  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.742443  normal  0.0537176 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2754  cupin 2 domain-containing protein  67.86 
 
 		 141 aa  191  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.151097 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1567  hypothetical protein  66.42 
 
 		 140 aa  188  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2942  hypothetical protein  63.97 
 
 		 144 aa  186  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6897  Cupin 2 conserved barrel domain protein  63.24 
 
 		 144 aa  185  2e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800776  normal  0.40787 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4216  cupin 2 domain-containing protein  66.92 
 
 		 138 aa  184  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.014913 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0701  cupin 2 domain-containing protein  63.91 
 
 		 141 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.608661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5282  hypothetical protein  43.08 
 
 		 191 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.274603 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.12 
 
 		 132 aa  90.5  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0171538  hitchhiker  0.000000529343 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0505  hypothetical protein  43.69 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  39.01 
 
 		 150 aa  88.6  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5798  cupin 2 domain-containing protein  36.88 
 
 		 150 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1401  hypothetical protein  38.81 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.325254 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0939  hypothetical protein  33.63 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.95 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0193  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.94 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.539282  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1532  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7188  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40 
 
 		 152 aa  40.4  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>