40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2295 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 166 aa  326  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  39.22 
 
 		 163 aa  95.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.54 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  36.94 
 
 		 163 aa  83.6  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.03 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  32.72 
 
 		 171 aa  74.3  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  30.63 
 
 		 338 aa  73.9  0.0000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.67 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  38.35 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.1 
 
 		 159 aa  64.3  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  32.62 
 
 		 174 aa  64.3  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.52 
 
 		 192 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.87 
 
 		 169 aa  62.4  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.93 
 
 		 389 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.24 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.36 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.36 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.66 
 
 		 159 aa  52.4  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  25.19 
 
 		 145 aa  51.2  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.43 
 
 		 160 aa  48.9  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.23 
 
 		 163 aa  48.1  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  27.52 
 
 		 179 aa  48.1  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  29.37 
 
 		 163 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0829  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.49 
 
 		 153 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.55618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.48 
 
 		 356 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.22 
 
 		 182 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.44 
 
 		 163 aa  44.7  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  44.9 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  30.07 
 
 		 163 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3746  cupin 2 domain-containing protein  38 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  33 
 
 		 207 aa  42.7  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.68 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  28 
 
 		 355 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0625  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 151 aa  42.4  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00815435 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1841  cupin 2, barrel  30.95 
 
 		 141 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0498378 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.16 
 
 		 149 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 377 aa  41.2  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  30.53 
 
 		 153 aa  40.4  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>