46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2781 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  100 
 
 		 338 aa  688    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.48 
 
 		 377 aa  142  8e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11002  dioxygenase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G07350)  33 
 
 		 355 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.627949  normal  0.657367 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.41 
 
 		 389 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.04 
 
 		 356 aa  127  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06772  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 		 372 aa  83.2  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.63 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  32.28 
 
 		 163 aa  67.8  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  63.2  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  31.15 
 
 		 171 aa  62  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.21 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  26.54 
 
 		 179 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 149 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  33.01 
 
 		 190 aa  53.1  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  30.85 
 
 		 155 aa  52.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.5 
 
 		 169 aa  52  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 147 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.63 
 
 		 145 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 		 166 aa  49.7  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  42.37 
 
 		 152 aa  49.3  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.69 
 
 		 182 aa  47.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.27 
 
 		 159 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  32.63 
 
 		 158 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.78 
 
 		 159 aa  48.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0784  cupin 2 domain-containing protein  26.96 
 
 		 129 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0399886  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.97 
 
 		 153 aa  47  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.77 
 
 		 152 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  28.1 
 
 		 174 aa  47  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  39.39 
 
 		 141 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.1 
 
 		 165 aa  46.2  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  29.66 
 
 		 152 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.95 
 
 		 204 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  44 
 
 		 148 aa  45.8  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  30.38 
 
 		 145 aa  44.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0737  cupin 2 domain-containing protein  33.73 
 
 		 207 aa  45.1  0.002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  21.82 
 
 		 204 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4294  cupin 2 domain-containing protein  24.51 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.689611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 181 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.94 
 
 		 163 aa  43.9  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 181 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2898  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 181 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 181 aa  43.9  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  20.83 
 
 		 145 aa  43.5  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.09 
 
 		 169 aa  43.5  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.89 
 
 		 160 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1980  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.54 
 
 		 130 aa  42.7  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>