226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3902 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 166 aa  343  6e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.55 
 
 		 169 aa  100  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.86 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.1 
 
 		 192 aa  91.7  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.67 
 
 		 160 aa  77.4  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  34.65 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.94 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.94 
 
 		 204 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.82 
 
 		 169 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  34.48 
 
 		 163 aa  67.4  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.29 
 
 		 159 aa  66.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  33.88 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  38.75 
 
 		 147 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3503  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.15 
 
 		 182 aa  65.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  32.46 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  32.46 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  32.46 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  32.46 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  32.46 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  32.46 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  31.19 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  31.19 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  31.78 
 
 		 147 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  33.06 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.04 
 
 		 160 aa  61.2  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 		 191 aa  60.8  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  36 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.54 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  32.28 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  31.67 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  31.08 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  30.51 
 
 		 163 aa  58.2  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.51 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  34.91 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4882  hypothetical protein  28.71 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  33.01 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  31.73 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  45.9 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  29.09 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  35.92 
 
 		 141 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1457  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.96188e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6135  hypothetical protein  41.79 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.715074  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4562  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.38 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.2 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1041  cupin 2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 311 aa  53.5  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.421449  normal  0.0580221 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1827  hypothetical protein  34.52 
 
 		 121 aa  53.1  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  31.86 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0204  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.9 
 
 		 160 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  32.54 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 165 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1603  cupin 2 domain-containing protein  29.41 
 
 		 123 aa  52  0.000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3067  cupin 2 domain-containing protein  29.7 
 
 		 145 aa  52  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.55 
 
 		 159 aa  51.6  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  34.02 
 
 		 157 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3217  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  31.87 
 
 		 185 aa  51.2  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00931444 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  31.25 
 
 		 163 aa  51.2  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  27.64 
 
 		 169 aa  51.2  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  35.56 
 
 		 174 aa  50.8  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  36.36 
 
 		 150 aa  50.8  0.000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3140  conserved hypothetical phosphomannose protein  34.74 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 184 aa  50.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01276  DNA-binding transcriptional repressor  41.38 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2347  transcriptional regulator, XRE family  41.38 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.204857  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1509  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  41.38 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1823  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  41.38 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0706879 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1535  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  41.38 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01287  hypothetical protein  41.38 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 149 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2326  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  41.38 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  32.14 
 
 		 338 aa  49.7  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  40.32 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1941  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  41.38 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.385308 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1414  DNA-binding transcriptional repressor PuuR  41.38 
 
 		 185 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.16 
 
 		 163 aa  48.9  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  31.4 
 
 		 178 aa  48.5  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0303  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.53 
 
 		 121 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.26 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3039  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.34 
 
 		 112 aa  47.8  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.124018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00345  cupin domain protein  30.38 
 
 		 121 aa  47.4  0.00009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00219915  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3773  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.01 
 
 		 421 aa  47.4  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.239832  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0906  cupin region  33.33 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.168616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5804  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.67 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2799  hypothetical protein  32.47 
 
 		 104 aa  47  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7832900000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3287  cupin 2 domain-containing protein  35.63 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.927122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  36.21 
 
 		 201 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  26.5 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.1 
 
 		 117 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69980  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 		 182 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0802  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.71 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0134  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.44 
 
 		 118 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2770  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  34.74 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2249  cupin 2, barrel  28.87 
 
 		 143 aa  46.6  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  28.57 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.45 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  29.27 
 
 		 135 aa  45.8  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>