80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1923 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 145 aa  299  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  35.43 
 
 		 190 aa  70.5  0.000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 166 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.47 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.85 
 
 		 160 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 189 aa  57  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.41 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  44.44 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.15 
 
 		 165 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  32 
 
 		 163 aa  52.8  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  34.83 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  30.43 
 
 		 163 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.96 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.93 
 
 		 156 aa  51.2  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.17 
 
 		 160 aa  50.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  31 
 
 		 163 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1173  cupin 2 domain-containing protein  43.48 
 
 		 316 aa  50.1  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5448  cupin 2, barrel  35.48 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.708388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5845  cupin 2 domain-containing protein  35.48 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2781  cupin 2, barrel  32.63 
 
 		 338 aa  49.7  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.402218  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1700  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.792463 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0630  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0548  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.915131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1649  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.316822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0535  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5649  cupin 2 domain-containing protein  35.44 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1675  cupin 2, barrel  35.44 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  29.63 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.23 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  31.76 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  49.09 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.53 
 
 		 204 aa  47.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  30.59 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  35.53 
 
 		 191 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.53 
 
 		 204 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.93 
 
 		 181 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0454  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.1 
 
 		 356 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  29.13 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.97 
 
 		 163 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33680  Protein of unknown function (DUF861)  34.72 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.741976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.68 
 
 		 184 aa  45.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0452  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.57 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 181 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  30.59 
 
 		 138 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  37.5 
 
 		 133 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0119  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.52 
 
 		 195 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.338448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  29.85 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1444  cupin 2 domain-containing protein  32.79 
 
 		 132 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  43.75 
 
 		 147 aa  43.5  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  34.43 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  32.84 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.85 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2072  auxin-binding protein, putative  28.87 
 
 		 167 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0382674  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  41.54 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4297  cupin 2 domain-containing protein  34.72 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2898  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  30.43 
 
 		 171 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.6 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  30.68 
 
 		 141 aa  42.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  28.72 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2037  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.79 
 
 		 112 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0486792  normal  0.209563 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1579  TonB box-like  35.48 
 
 		 151 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2228  cupin 2 domain-containing protein  28.26 
 
 		 166 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300974 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1607  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.88 
 
 		 158 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.978873  normal  0.178437 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.58 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  30.26 
 
 		 205 aa  41.2  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1882  auxin-binding protein, putative  28.87 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.8 
 
 		 163 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  30.12 
 
 		 165 aa  41.2  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2685  hypothetical protein  30.56 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.273941  normal  0.254874 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.12 
 
 		 117 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1030  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.82 
 
 		 112 aa  40.8  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.36 
 
 		 121 aa  40.8  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2295  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.77 
 
 		 166 aa  40  0.009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  30.77 
 
 		 149 aa  40  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0540  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 113 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2878  N-acetylneuraminic acid synthase domain protein  38.6 
 
 		 497 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.251215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>