54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3707 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  100 
 
 		 138 aa  283  5.999999999999999e-76  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  64.71 
 
 		 139 aa  191  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  56.06 
 
 		 135 aa  157  7e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.96 
 
 		 135 aa  145  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.31 
 
 		 160 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  37.63 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  37.08 
 
 		 166 aa  60.8  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 163 aa  60.1  0.000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  36.36 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.69 
 
 		 163 aa  57  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  32.99 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.63 
 
 		 192 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  29.55 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.1 
 
 		 169 aa  51.2  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  30.65 
 
 		 178 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2831  cupin 2 domain-containing protein  34.78 
 
 		 117 aa  51.2  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2609  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.06 
 
 		 160 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.29 
 
 		 172 aa  49.3  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  29.17 
 
 		 150 aa  48.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.02 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  29.29 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.84 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.37 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3902  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.5 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.760355  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  28.23 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  28.23 
 
 		 165 aa  47  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  28.23 
 
 		 165 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1069  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.68 
 
 		 117 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.486556 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.2 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.78 
 
 		 184 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.09 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0262  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.14 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.11735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.43 
 
 		 204 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  27.12 
 
 		 189 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.87 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.59 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.18 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5062  hypothetical protein  31.4 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.406339 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.43 
 
 		 204 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  32.58 
 
 		 169 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  29.29 
 
 		 163 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.68 
 
 		 159 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4006  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 137 aa  42.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  27.12 
 
 		 141 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  43.75 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  32.26 
 
 		 149 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  26.02 
 
 		 171 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1397  cupin 2 domain-containing protein  30.56 
 
 		 115 aa  40.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0319163  normal  0.27943 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2583  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 115 aa  40.4  0.008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0378  cupin region  40.43 
 
 		 153 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.930622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>