36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0483 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 172 aa  355  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  36.43 
 
 		 158 aa  84.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.11 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  29.1 
 
 		 166 aa  65.5  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  34.74 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  32.03 
 
 		 163 aa  63.9  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  33.68 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.49 
 
 		 192 aa  62  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  34.44 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  34.44 
 
 		 165 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  34.44 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.76 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.25 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.58 
 
 		 163 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  27.2 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  27.33 
 
 		 158 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  26.27 
 
 		 135 aa  50.8  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  35.63 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  32.29 
 
 		 138 aa  49.3  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  25.89 
 
 		 179 aa  48.5  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  25.19 
 
 		 141 aa  48.1  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.4 
 
 		 135 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 169 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.43 
 
 		 190 aa  47.4  0.00009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2213  cupin 2 domain-containing protein  30.1 
 
 		 125 aa  47.4  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.971914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6281  hypothetical protein  29.79 
 
 		 149 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  24.82 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.76 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3908  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.36 
 
 		 186 aa  44.7  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.399642  normal  0.0760956 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  22.95 
 
 		 181 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  23.66 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.32 
 
 		 169 aa  43.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  30.19 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.86 
 
 		 144 aa  42.7  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.64 
 
 		 165 aa  42  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3197  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.41 
 
 		 191 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229687  normal  0.39078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>