36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1878 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  100 
 
 		 158 aa  318  1.9999999999999998e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  43.14 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  38.41 
 
 		 161 aa  117  9e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  35.43 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  31.5 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  29.37 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.73 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.33 
 
 		 172 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.82 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  29.47 
 
 		 163 aa  52  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.79 
 
 		 170 aa  51.6  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  27.56 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  27.56 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  27.56 
 
 		 165 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0109  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.64 
 
 		 377 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.146013 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1923  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.63 
 
 		 145 aa  48.5  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0356258  normal  0.456316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0950  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.26 
 
 		 389 aa  47.8  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1593  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.58 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.147547 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  27.03 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.79 
 
 		 144 aa  45.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3647  cupin 2 domain-containing protein  28 
 
 		 149 aa  44.3  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.03 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0565  hypothetical protein  27.52 
 
 		 155 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.916683  normal  0.52627 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  32.69 
 
 		 135 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  29.79 
 
 		 192 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.49 
 
 		 165 aa  42.7  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0223  cupin 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2327  cupin 2 domain-containing protein  27.27 
 
 		 150 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000139899 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3997  cupin 2 domain-containing protein  28.99 
 
 		 148 aa  42  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.439431  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  28.12 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6348  cupin 2 domain-containing protein  28.33 
 
 		 163 aa  42  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2409  cupin family protein  30.86 
 
 		 114 aa  40.8  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116838  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  26.98 
 
 		 150 aa  40.8  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3113  cupin 2 domain-containing protein  39.71 
 
 		 174 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.487782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5139  Cupin 2 conserved barrel domain protein  38.46 
 
 		 126 aa  40.4  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0784  cupin 2 domain-containing protein  33.33 
 
 		 129 aa  40.4  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0399886  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>