80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1864 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 144 aa  299  8.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1714  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.259313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5545  cupin 2 domain-containing protein  40 
 
 		 141 aa  116  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3191  cupin 2, barrel  32.61 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000053457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0144  cupin 2 domain-containing protein  30 
 
 		 165 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3556  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.6 
 
 		 169 aa  61.2  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3706  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.34 
 
 		 163 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5299  hypothetical protein  23.48 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0595  cupin 2 domain-containing protein  28.16 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0617  cupin 2 domain-containing protein  28.16 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.546436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0604  cupin 2, barrel  28.16 
 
 		 165 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.398371  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2141  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.28 
 
 		 159 aa  57.4  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5435  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.79 
 
 		 149 aa  57  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.657648 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4239  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.89 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.637233  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0760  cupin 2 domain-containing protein  26.21 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.519438 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0633  cupin 2 domain-containing protein  23.94 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.643791  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4108  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.81 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3405  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.72 
 
 		 156 aa  53.9  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0837  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3189  cupin 2, barrel  24.24 
 
 		 190 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00000805068  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1228  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.57 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.066401  normal  0.685252 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0884  cupin 2, barrel  24.82 
 
 		 191 aa  50.8  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2309  hypothetical protein  28.72 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.5332  hitchhiker  0.00622303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1181  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.6 
 
 		 192 aa  48.9  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.229288 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5660  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.08 
 
 		 170 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.215719 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1709  cupin 2, barrel  31.4 
 
 		 163 aa  48.1  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.448021 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4525  cupin 2 domain-containing protein  30.39 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3791  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.85 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.302037  normal  0.0222415 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0102  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.12 
 
 		 204 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.66506 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2964  Cupin 2 conserved barrel domain protein  20.93 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.75352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0747  cupin-like protein  23.68 
 
 		 169 aa  47.4  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.179804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1447  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 		 190 aa  47.4  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.901222  normal  0.428247 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2268  hypothetical protein  38.03 
 
 		 117 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0105  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.12 
 
 		 204 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  31.31 
 
 		 163 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3707  cupin 2, barrel  26.37 
 
 		 138 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.52835  normal  0.602346 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3153  cupin 2 domain-containing protein  27.88 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  36.9 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1878  Cupin 2 conserved barrel domain-containing protein  24.79 
 
 		 158 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0087666  normal  0.0137906 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5084  cupin superfamily protein  32.32 
 
 		 147 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259637  normal  0.536671 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.14 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.90971 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0320  cupin 2 domain-containing protein  29 
 
 		 146 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.864661  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3638  cupin 2 domain-containing protein  27.72 
 
 		 152 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.588869  normal  0.0557412 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4126  cupin 2 domain-containing protein  32.69 
 
 		 119 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2004  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.9 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0577  cupin 2 domain-containing protein  34.94 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0692  cupin 2 domain-containing protein  30.59 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1207  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.84 
 
 		 152 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.830198  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2790  cupin 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.94 
 
 		 139 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6233  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.82 
 
 		 163 aa  44.3  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.398434  normal  0.379299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3501  Cupin 2 conserved barrel domain protein  24.44 
 
 		 184 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1043  cupin 2 domain-containing protein  26.09 
 
 		 181 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5268  Cro/CI family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  33.77 
 
 		 269 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3867  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.14 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.468547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3363  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.66 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.331871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5320  XRE family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 182 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.8166  normal  0.310919 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5178  XRE family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 199 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6634  cupin 2 domain-containing protein  25.62 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1509  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 191 aa  42.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.155895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1032  Cupin 2 conserved barrel domain protein  43.48 
 
 		 121 aa  42.4  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0483  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.86 
 
 		 172 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.319109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4406  Cupin 2 conserved barrel domain protein  23.53 
 
 		 169 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0295153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0202  XRE family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 182 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.614203  hitchhiker  0.00167713 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0115  transcriptional regulatory protein  29.07 
 
 		 194 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  33.77 
 
 		 269 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 181 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3411  transcriptional regulator, XRE family  28.3 
 
 		 183 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2620  Cupin 2 conserved barrel domain protein  33.33 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.824016 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2121  Cupin 2 conserved barrel domain protein  26.67 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.625862  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4149  hypothetical protein  30.16 
 
 		 150 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.26535  decreased coverage  0.0023385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3716  cupin 2, barrel  29 
 
 		 129 aa  40.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000701811  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4834  transcriptional regulator, XRE family  26.42 
 
 		 182 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.197047  normal  0.0345523 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  30.99 
 
 		 171 aa  40.4  0.008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0973  Cupin 2 conserved barrel domain protein  36.62 
 
 		 118 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28 
 
 		 133 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 181 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 181 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2898  XRE family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 181 aa  40  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>