21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0577 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0577  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  282  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0587  Cupin 2 conserved barrel domain protein  98.56 
 
 		 139 aa  279  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.90971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0551  Cupin 2 conserved barrel domain protein  90.65 
 
 		 139 aa  257  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.807584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1804  cupin 2 domain-containing protein  60.8 
 
 		 148 aa  154  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1177  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60 
 
 		 152 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1566  cupin 2 domain-containing protein  57.46 
 
 		 141 aa  149  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.826475  normal  0.129354 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2004  Cupin 2 conserved barrel domain protein  60 
 
 		 141 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1685  cupin 2 domain-containing protein  59.2 
 
 		 141 aa  140  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1874  Cupin 2 conserved barrel domain protein  50.74 
 
 		 142 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.935294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4362  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.4 
 
 		 153 aa  130  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.951777 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2974  cupin 2 domain-containing protein  42.62 
 
 		 152 aa  105  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.19982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3146  cupin 2 domain-containing protein  43.55 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1864  Cupin 2 conserved barrel domain protein  34.94 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4417  cupin:cupin region  31.51 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2969  cupin 2  37.84 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  39.39 
 
 		 200 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3098  cupin 2 protein  36.21 
 
 		 122 aa  42  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.798535  normal  0.375824 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5012  hypothetical protein  40.43 
 
 		 155 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0120588  normal  0.173507 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7008  hypothetical protein  38.1 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0126624  hitchhiker  0.000933462 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3988  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.7 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.507618  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3858  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.94 
 
 		 133 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>